Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GOLGA6BA6NDN3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6BA6NDN3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GOLGA6BA6NDN3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms