Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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