Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WV48

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WV48 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087WV48 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WV48 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WV48 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WV48 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WV48 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WV48 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WV48 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WV48 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WV48 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WV48 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WV48 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WV48 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WV48 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WV48 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WV48 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WV48 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WV48 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WV48 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WV48 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WV48 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WV48 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WV48 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WV48 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WV48 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WV48 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WV48 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WV48 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WV48 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A087WV48 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A087WV48 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A087WV48 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WV48 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WV48 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WV48 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WV48 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WV48 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WV48 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WV48 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WV48 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WV48 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WV48 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WV48 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WV48 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WV48 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WV48 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV48 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV48 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV48 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV48 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV48 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV48 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV48 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV48 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV48 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV48 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV48 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WV48 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV48 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV48 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV48 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV48 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV48 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV48 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV48 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV48 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV48 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV48 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV48 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV48 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV48 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WV48 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WV48 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WV48 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WV48 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WV48 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WV48 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WV48 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WV48 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WV48 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WV48 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WV48 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WV48 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WV48 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WV48 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WV48 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WV48 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087WV48 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087WV48 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WV48 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WV48 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WV48 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WV48 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WV48 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WV48 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WV48 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WV48 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WV48 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WV48 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WV48 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms