Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHGA8Q9Y5G5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHGA8Q9Y5G5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHGA8Q9Y5G5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHGA8Q9Y5G5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHGA8Q9Y5G5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHGA8Q9Y5G5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHGA8Q9Y5G5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHGA8Q9Y5G5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDHGA8Q9Y5G5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDHGA8Q9Y5G5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHGA8Q9Y5G5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHGA8Q9Y5G5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHGA8Q9Y5G5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PCDHGA8Q9Y5G5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHGA8Q9Y5G5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHGA8Q9Y5G5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHGA8Q9Y5G5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHGA8Q9Y5G5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHGA8Q9Y5G5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHGA8Q9Y5G5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHGA8Q9Y5G5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHGA8Q9Y5G5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHGA8Q9Y5G5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHGA8Q9Y5G5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHGA8Q9Y5G5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHGA8Q9Y5G5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHGA8Q9Y5G5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHGA8Q9Y5G5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHGA8Q9Y5G5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHGA8Q9Y5G5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCDHGA8Q9Y5G5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHGA8Q9Y5G5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHGA8Q9Y5G5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHGA8Q9Y5G5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHGA8Q9Y5G5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHGA8Q9Y5G5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHGA8Q9Y5G5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHGA8Q9Y5G5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHGA8Q9Y5G5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHGA8Q9Y5G5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHGA8Q9Y5G5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHGA8Q9Y5G5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHGA8Q9Y5G5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHGA8Q9Y5G5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHGA8Q9Y5G5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHGA8Q9Y5G5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHGA8Q9Y5G5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHGA8Q9Y5G5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHGA8Q9Y5G5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHGA8Q9Y5G5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHGA8Q9Y5G5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHGA8Q9Y5G5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHGA8Q9Y5G5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHGA8Q9Y5G5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHGA8Q9Y5G5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHGA8Q9Y5G5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHGA8Q9Y5G5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHGA8Q9Y5G5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHGA8Q9Y5G5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHGA8Q9Y5G5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHGA8Q9Y5G5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PCDHGA8Q9Y5G5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHGA8Q9Y5G5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHGA8Q9Y5G5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHGA8Q9Y5G5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHGA8Q9Y5G5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHGA8Q9Y5G5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHGA8Q9Y5G5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHGA8Q9Y5G5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHGA8Q9Y5G5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHGA8Q9Y5G5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHGA8Q9Y5G5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHGA8Q9Y5G5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PCDHGA8Q9Y5G5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHGA8Q9Y5G5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHGA8Q9Y5G5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHGA8Q9Y5G5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHGA8Q9Y5G5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHGA8Q9Y5G5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCDHGA8Q9Y5G5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHGA8Q9Y5G5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCDHGA8Q9Y5G5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHGA8Q9Y5G5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCDHGA8Q9Y5G5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHGA8Q9Y5G5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHGA8Q9Y5G5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHGA8Q9Y5G5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHGA8Q9Y5G5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCDHGA8Q9Y5G5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHGA8Q9Y5G5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHGA8Q9Y5G5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHGA8Q9Y5G5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHGA8Q9Y5G5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHGA8Q9Y5G5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHGA8Q9Y5G5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHGA8Q9Y5G5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms