Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
NRXN1Q9ULB1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
NRXN1Q9ULB1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
NRXN1Q9ULB1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NRXN1Q9ULB1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
NRXN1Q9ULB1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.27
NRXN1Q9ULB1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
NRXN1Q9ULB1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
NRXN1Q9ULB1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
NRXN1Q9ULB1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
NRXN1Q9ULB1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
NRXN1Q9ULB1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
NRXN1Q9ULB1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
NRXN1Q9ULB1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
NRXN1Q9ULB1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
NRXN1Q9ULB1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
NRXN1Q9ULB1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
NRXN1Q9ULB1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
NRXN1Q9ULB1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NRXN1Q9ULB1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
NRXN1Q9ULB1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.36■■■■■ 4.21
NRXN1Q9ULB1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NRXN1Q9ULB1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
NRXN1Q9ULB1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
NRXN1Q9ULB1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
NRXN1Q9ULB1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
NRXN1Q9ULB1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
NRXN1Q9ULB1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
NRXN1Q9ULB1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
NRXN1Q9ULB1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
NRXN1Q9ULB1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
NRXN1Q9ULB1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
NRXN1Q9ULB1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
NRXN1Q9ULB1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
NRXN1Q9ULB1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
NRXN1Q9ULB1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
NRXN1Q9ULB1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
NRXN1Q9ULB1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
NRXN1Q9ULB1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
NRXN1Q9ULB1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
NRXN1Q9ULB1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
NRXN1Q9ULB1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
NRXN1Q9ULB1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
NRXN1Q9ULB1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
NRXN1Q9ULB1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
NRXN1Q9ULB1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC40.84■■■■■ 4.13
NRXN1Q9ULB1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
NRXN1Q9ULB1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
NRXN1Q9ULB1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
NRXN1Q9ULB1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
NRXN1Q9ULB1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
NRXN1Q9ULB1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
NRXN1Q9ULB1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
NRXN1Q9ULB1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
NRXN1Q9ULB1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
NRXN1Q9ULB1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
NRXN1Q9ULB1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
NRXN1Q9ULB1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
NRXN1Q9ULB1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
NRXN1Q9ULB1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
NRXN1Q9ULB1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
NRXN1Q9ULB1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
NRXN1Q9ULB1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
NRXN1Q9ULB1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
NRXN1Q9ULB1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
NRXN1Q9ULB1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
NRXN1Q9ULB1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
NRXN1Q9ULB1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
NRXN1Q9ULB1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
NRXN1Q9ULB1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
NRXN1Q9ULB1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NRXN1Q9ULB1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
NRXN1Q9ULB1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
NRXN1Q9ULB1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
NRXN1Q9ULB1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.07
NRXN1Q9ULB1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
NRXN1Q9ULB1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NRXN1Q9ULB1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
NRXN1Q9ULB1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
NRXN1Q9ULB1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
NRXN1Q9ULB1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
NRXN1Q9ULB1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
NRXN1Q9ULB1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
NRXN1Q9ULB1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
NRXN1Q9ULB1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
NRXN1Q9ULB1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
NRXN1Q9ULB1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NRXN1Q9ULB1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NRXN1Q9ULB1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
NRXN1Q9ULB1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NRXN1Q9ULB1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NRXN1Q9ULB1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
NRXN1Q9ULB1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
NRXN1Q9ULB1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NRXN1Q9ULB1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
NRXN1Q9ULB1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NRXN1Q9ULB1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
NRXN1Q9ULB1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.19■■■■■ 4.03
NRXN1Q9ULB1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
NRXN1Q9ULB1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms