Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHBDL2Q9NX52 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHBDL2Q9NX52 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHBDL2Q9NX52 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHBDL2Q9NX52 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHBDL2Q9NX52 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHBDL2Q9NX52 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDL2Q9NX52 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHBDL2Q9NX52 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHBDL2Q9NX52 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHBDL2Q9NX52 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHBDL2Q9NX52 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHBDL2Q9NX52 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHBDL2Q9NX52 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHBDL2Q9NX52 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHBDL2Q9NX52 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHBDL2Q9NX52 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHBDL2Q9NX52 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHBDL2Q9NX52 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHBDL2Q9NX52 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHBDL2Q9NX52 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHBDL2Q9NX52 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RHBDL2Q9NX52 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDL2Q9NX52 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RHBDL2Q9NX52 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RHBDL2Q9NX52 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RHBDL2Q9NX52 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RHBDL2Q9NX52 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDL2Q9NX52 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDL2Q9NX52 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RHBDL2Q9NX52 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RHBDL2Q9NX52 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHBDL2Q9NX52 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RHBDL2Q9NX52 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDL2Q9NX52 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDL2Q9NX52 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RHBDL2Q9NX52 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RHBDL2Q9NX52 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHBDL2Q9NX52 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHBDL2Q9NX52 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHBDL2Q9NX52 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHBDL2Q9NX52 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHBDL2Q9NX52 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHBDL2Q9NX52 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDL2Q9NX52 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDL2Q9NX52 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHBDL2Q9NX52 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDL2Q9NX52 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHBDL2Q9NX52 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHBDL2Q9NX52 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RHBDL2Q9NX52 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHBDL2Q9NX52 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDL2Q9NX52 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RHBDL2Q9NX52 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHBDL2Q9NX52 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHBDL2Q9NX52 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHBDL2Q9NX52 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHBDL2Q9NX52 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDL2Q9NX52 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDL2Q9NX52 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDL2Q9NX52 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHBDL2Q9NX52 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHBDL2Q9NX52 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDL2Q9NX52 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDL2Q9NX52 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDL2Q9NX52 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHBDL2Q9NX52 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL2Q9NX52 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RHBDL2Q9NX52 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL2Q9NX52 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHBDL2Q9NX52 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDL2Q9NX52 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDL2Q9NX52 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDL2Q9NX52 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHBDL2Q9NX52 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHBDL2Q9NX52 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL2Q9NX52 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL2Q9NX52 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHBDL2Q9NX52 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHBDL2Q9NX52 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHBDL2Q9NX52 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHBDL2Q9NX52 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHBDL2Q9NX52 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHBDL2Q9NX52 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHBDL2Q9NX52 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHBDL2Q9NX52 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHBDL2Q9NX52 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDL2Q9NX52 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHBDL2Q9NX52 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDL2Q9NX52 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHBDL2Q9NX52 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDL2Q9NX52 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHBDL2Q9NX52 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHBDL2Q9NX52 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHBDL2Q9NX52 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL2Q9NX52 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL2Q9NX52 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL2Q9NX52 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDL2Q9NX52 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms