Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNPLA3Q9NST1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNPLA3Q9NST1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNPLA3Q9NST1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNPLA3Q9NST1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNPLA3Q9NST1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNPLA3Q9NST1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNPLA3Q9NST1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNPLA3Q9NST1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNPLA3Q9NST1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PNPLA3Q9NST1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNPLA3Q9NST1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNPLA3Q9NST1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNPLA3Q9NST1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNPLA3Q9NST1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNPLA3Q9NST1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNPLA3Q9NST1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNPLA3Q9NST1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNPLA3Q9NST1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNPLA3Q9NST1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNPLA3Q9NST1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA3Q9NST1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNPLA3Q9NST1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNPLA3Q9NST1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNPLA3Q9NST1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNPLA3Q9NST1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNPLA3Q9NST1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNPLA3Q9NST1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNPLA3Q9NST1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNPLA3Q9NST1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNPLA3Q9NST1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNPLA3Q9NST1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNPLA3Q9NST1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNPLA3Q9NST1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PNPLA3Q9NST1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNPLA3Q9NST1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PNPLA3Q9NST1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PNPLA3Q9NST1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PNPLA3Q9NST1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PNPLA3Q9NST1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PNPLA3Q9NST1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNPLA3Q9NST1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PNPLA3Q9NST1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNPLA3Q9NST1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PNPLA3Q9NST1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNPLA3Q9NST1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNPLA3Q9NST1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNPLA3Q9NST1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNPLA3Q9NST1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNPLA3Q9NST1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNPLA3Q9NST1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNPLA3Q9NST1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNPLA3Q9NST1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNPLA3Q9NST1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PNPLA3Q9NST1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNPLA3Q9NST1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNPLA3Q9NST1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PNPLA3Q9NST1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PNPLA3Q9NST1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNPLA3Q9NST1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNPLA3Q9NST1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNPLA3Q9NST1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNPLA3Q9NST1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PNPLA3Q9NST1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PNPLA3Q9NST1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PNPLA3Q9NST1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNPLA3Q9NST1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNPLA3Q9NST1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA3Q9NST1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNPLA3Q9NST1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNPLA3Q9NST1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNPLA3Q9NST1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PNPLA3Q9NST1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNPLA3Q9NST1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPLA3Q9NST1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPLA3Q9NST1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNPLA3Q9NST1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNPLA3Q9NST1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNPLA3Q9NST1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNPLA3Q9NST1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNPLA3Q9NST1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PNPLA3Q9NST1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNPLA3Q9NST1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PNPLA3Q9NST1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNPLA3Q9NST1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PNPLA3Q9NST1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNPLA3Q9NST1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PNPLA3Q9NST1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNPLA3Q9NST1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PNPLA3Q9NST1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNPLA3Q9NST1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PNPLA3Q9NST1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PNPLA3Q9NST1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNPLA3Q9NST1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PNPLA3Q9NST1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PNPLA3Q9NST1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNPLA3Q9NST1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNPLA3Q9NST1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PNPLA3Q9NST1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PNPLA3Q9NST1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms