Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CDK19Q9BWU1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CDK19Q9BWU1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.11
CDK19Q9BWU1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CDK19Q9BWU1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CDK19Q9BWU1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CDK19Q9BWU1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CDK19Q9BWU1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
CDK19Q9BWU1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
CDK19Q9BWU1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
CDK19Q9BWU1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CDK19Q9BWU1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CDK19Q9BWU1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CDK19Q9BWU1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CDK19Q9BWU1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CDK19Q9BWU1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CDK19Q9BWU1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
CDK19Q9BWU1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
CDK19Q9BWU1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CDK19Q9BWU1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
CDK19Q9BWU1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CDK19Q9BWU1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CDK19Q9BWU1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CDK19Q9BWU1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CDK19Q9BWU1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CDK19Q9BWU1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CDK19Q9BWU1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CDK19Q9BWU1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CDK19Q9BWU1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CDK19Q9BWU1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CDK19Q9BWU1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CDK19Q9BWU1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CDK19Q9BWU1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
CDK19Q9BWU1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CDK19Q9BWU1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CDK19Q9BWU1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CDK19Q9BWU1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CDK19Q9BWU1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
CDK19Q9BWU1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
CDK19Q9BWU1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CDK19Q9BWU1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CDK19Q9BWU1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CDK19Q9BWU1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.99
CDK19Q9BWU1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CDK19Q9BWU1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CDK19Q9BWU1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CDK19Q9BWU1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CDK19Q9BWU1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CDK19Q9BWU1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
CDK19Q9BWU1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CDK19Q9BWU1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CDK19Q9BWU1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
CDK19Q9BWU1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
CDK19Q9BWU1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CDK19Q9BWU1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
CDK19Q9BWU1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
CDK19Q9BWU1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
CDK19Q9BWU1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
CDK19Q9BWU1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
CDK19Q9BWU1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
CDK19Q9BWU1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
CDK19Q9BWU1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
CDK19Q9BWU1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CDK19Q9BWU1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CDK19Q9BWU1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CDK19Q9BWU1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
CDK19Q9BWU1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CDK19Q9BWU1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
CDK19Q9BWU1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CDK19Q9BWU1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CDK19Q9BWU1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
CDK19Q9BWU1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
CDK19Q9BWU1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
CDK19Q9BWU1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
CDK19Q9BWU1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CDK19Q9BWU1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
CDK19Q9BWU1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CDK19Q9BWU1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.9
CDK19Q9BWU1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CDK19Q9BWU1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CDK19Q9BWU1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CDK19Q9BWU1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CDK19Q9BWU1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CDK19Q9BWU1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CDK19Q9BWU1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CDK19Q9BWU1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CDK19Q9BWU1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
CDK19Q9BWU1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CDK19Q9BWU1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CDK19Q9BWU1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CDK19Q9BWU1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CDK19Q9BWU1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CDK19Q9BWU1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CDK19Q9BWU1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CDK19Q9BWU1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CDK19Q9BWU1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
CDK19Q9BWU1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CDK19Q9BWU1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CDK19Q9BWU1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
CDK19Q9BWU1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms