Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC9Q96Q05 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC9Q96Q05 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC9Q96Q05 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC9Q96Q05 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC9Q96Q05 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC9Q96Q05 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC9Q96Q05 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC9Q96Q05 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC9Q96Q05 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC9Q96Q05 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC9Q96Q05 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC9Q96Q05 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAPPC9Q96Q05 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC9Q96Q05 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC9Q96Q05 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRAPPC9Q96Q05 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC9Q96Q05 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC9Q96Q05 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC9Q96Q05 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC9Q96Q05 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC9Q96Q05 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC9Q96Q05 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC9Q96Q05 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC9Q96Q05 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC9Q96Q05 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC9Q96Q05 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC9Q96Q05 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC9Q96Q05 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRAPPC9Q96Q05 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC9Q96Q05 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC9Q96Q05 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC9Q96Q05 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC9Q96Q05 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC9Q96Q05 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC9Q96Q05 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC9Q96Q05 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC9Q96Q05 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC9Q96Q05 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC9Q96Q05 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC9Q96Q05 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC9Q96Q05 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC9Q96Q05 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC9Q96Q05 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC9Q96Q05 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC9Q96Q05 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC9Q96Q05 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC9Q96Q05 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC9Q96Q05 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC9Q96Q05 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC9Q96Q05 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC9Q96Q05 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAPPC9Q96Q05 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC9Q96Q05 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC9Q96Q05 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC9Q96Q05 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAPPC9Q96Q05 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC9Q96Q05 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC9Q96Q05 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC9Q96Q05 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC9Q96Q05 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC9Q96Q05 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC9Q96Q05 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC9Q96Q05 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC9Q96Q05 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC9Q96Q05 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC9Q96Q05 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC9Q96Q05 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC9Q96Q05 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC9Q96Q05 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAPPC9Q96Q05 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAPPC9Q96Q05 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAPPC9Q96Q05 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC9Q96Q05 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC9Q96Q05 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC9Q96Q05 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC9Q96Q05 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC9Q96Q05 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC9Q96Q05 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC9Q96Q05 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC9Q96Q05 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC9Q96Q05 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC9Q96Q05 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC9Q96Q05 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC9Q96Q05 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC9Q96Q05 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC9Q96Q05 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC9Q96Q05 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC9Q96Q05 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC9Q96Q05 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC9Q96Q05 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC9Q96Q05 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAPPC9Q96Q05 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC9Q96Q05 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms