Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NME9Q86XW9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NME9Q86XW9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
NME9Q86XW9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
NME9Q86XW9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
NME9Q86XW9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
NME9Q86XW9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
NME9Q86XW9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
NME9Q86XW9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
NME9Q86XW9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
NME9Q86XW9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
NME9Q86XW9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
NME9Q86XW9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC39.64■■■■□ 3.94
NME9Q86XW9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
NME9Q86XW9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
NME9Q86XW9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
NME9Q86XW9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
NME9Q86XW9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
NME9Q86XW9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NME9Q86XW9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
NME9Q86XW9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NME9Q86XW9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
NME9Q86XW9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NME9Q86XW9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NME9Q86XW9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
NME9Q86XW9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NME9Q86XW9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
NME9Q86XW9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
NME9Q86XW9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
NME9Q86XW9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NME9Q86XW9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NME9Q86XW9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
NME9Q86XW9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
NME9Q86XW9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
NME9Q86XW9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
NME9Q86XW9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
NME9Q86XW9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NME9Q86XW9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NME9Q86XW9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NME9Q86XW9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NME9Q86XW9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NME9Q86XW9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NME9Q86XW9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
NME9Q86XW9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
NME9Q86XW9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
NME9Q86XW9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
NME9Q86XW9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.01■■■■□ 3.84
NME9Q86XW9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
NME9Q86XW9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
NME9Q86XW9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
NME9Q86XW9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
NME9Q86XW9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
NME9Q86XW9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
NME9Q86XW9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
NME9Q86XW9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
NME9Q86XW9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
NME9Q86XW9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
NME9Q86XW9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
NME9Q86XW9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NME9Q86XW9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
NME9Q86XW9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
NME9Q86XW9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
NME9Q86XW9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
NME9Q86XW9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
NME9Q86XW9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
NME9Q86XW9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NME9Q86XW9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
NME9Q86XW9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NME9Q86XW9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
NME9Q86XW9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
NME9Q86XW9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
NME9Q86XW9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
NME9Q86XW9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
NME9Q86XW9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
NME9Q86XW9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
NME9Q86XW9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NME9Q86XW9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NME9Q86XW9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NME9Q86XW9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NME9Q86XW9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NME9Q86XW9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
NME9Q86XW9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NME9Q86XW9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
NME9Q86XW9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
NME9Q86XW9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NME9Q86XW9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NME9Q86XW9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NME9Q86XW9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NME9Q86XW9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NME9Q86XW9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
NME9Q86XW9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
NME9Q86XW9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NME9Q86XW9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
NME9Q86XW9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NME9Q86XW9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NME9Q86XW9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NME9Q86XW9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
NME9Q86XW9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NME9Q86XW9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NME9Q86XW9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms