Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RBBP6Q7Z6E9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RBBP6Q7Z6E9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RBBP6Q7Z6E9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RBBP6Q7Z6E9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RBBP6Q7Z6E9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RBBP6Q7Z6E9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RBBP6Q7Z6E9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RBBP6Q7Z6E9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RBBP6Q7Z6E9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RBBP6Q7Z6E9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RBBP6Q7Z6E9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RBBP6Q7Z6E9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RBBP6Q7Z6E9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RBBP6Q7Z6E9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RBBP6Q7Z6E9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RBBP6Q7Z6E9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RBBP6Q7Z6E9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RBBP6Q7Z6E9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RBBP6Q7Z6E9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RBBP6Q7Z6E9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RBBP6Q7Z6E9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RBBP6Q7Z6E9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.79■■■■□ 3
RBBP6Q7Z6E9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.77■■■■□ 3
RBBP6Q7Z6E9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RBBP6Q7Z6E9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
RBBP6Q7Z6E9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RBBP6Q7Z6E9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
RBBP6Q7Z6E9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RBBP6Q7Z6E9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RBBP6Q7Z6E9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RBBP6Q7Z6E9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RBBP6Q7Z6E9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RBBP6Q7Z6E9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RBBP6Q7Z6E9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RBBP6Q7Z6E9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RBBP6Q7Z6E9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RBBP6Q7Z6E9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
RBBP6Q7Z6E9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RBBP6Q7Z6E9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RBBP6Q7Z6E9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RBBP6Q7Z6E9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RBBP6Q7Z6E9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RBBP6Q7Z6E9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
RBBP6Q7Z6E9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RBBP6Q7Z6E9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RBBP6Q7Z6E9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RBBP6Q7Z6E9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RBBP6Q7Z6E9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RBBP6Q7Z6E9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RBBP6Q7Z6E9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RBBP6Q7Z6E9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RBBP6Q7Z6E9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RBBP6Q7Z6E9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RBBP6Q7Z6E9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
RBBP6Q7Z6E9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RBBP6Q7Z6E9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RBBP6Q7Z6E9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RBBP6Q7Z6E9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RBBP6Q7Z6E9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RBBP6Q7Z6E9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RBBP6Q7Z6E9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RBBP6Q7Z6E9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RBBP6Q7Z6E9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RBBP6Q7Z6E9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RBBP6Q7Z6E9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RBBP6Q7Z6E9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RBBP6Q7Z6E9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RBBP6Q7Z6E9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RBBP6Q7Z6E9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
RBBP6Q7Z6E9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
RBBP6Q7Z6E9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RBBP6Q7Z6E9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RBBP6Q7Z6E9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RBBP6Q7Z6E9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RBBP6Q7Z6E9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RBBP6Q7Z6E9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RBBP6Q7Z6E9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
RBBP6Q7Z6E9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RBBP6Q7Z6E9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RBBP6Q7Z6E9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RBBP6Q7Z6E9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RBBP6Q7Z6E9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RBBP6Q7Z6E9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RBBP6Q7Z6E9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RBBP6Q7Z6E9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RBBP6Q7Z6E9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RBBP6Q7Z6E9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
RBBP6Q7Z6E9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RBBP6Q7Z6E9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
RBBP6Q7Z6E9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RBBP6Q7Z6E9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RBBP6Q7Z6E9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RBBP6Q7Z6E9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RBBP6Q7Z6E9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
RBBP6Q7Z6E9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
RBBP6Q7Z6E9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RBBP6Q7Z6E9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RBBP6Q7Z6E9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms