Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
OTOP3Q7RTS5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
OTOP3Q7RTS5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
OTOP3Q7RTS5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
OTOP3Q7RTS5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
OTOP3Q7RTS5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
OTOP3Q7RTS5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
OTOP3Q7RTS5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
OTOP3Q7RTS5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
OTOP3Q7RTS5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
OTOP3Q7RTS5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
OTOP3Q7RTS5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
OTOP3Q7RTS5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
OTOP3Q7RTS5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
OTOP3Q7RTS5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
OTOP3Q7RTS5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
OTOP3Q7RTS5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
OTOP3Q7RTS5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
OTOP3Q7RTS5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
OTOP3Q7RTS5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
OTOP3Q7RTS5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
OTOP3Q7RTS5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
OTOP3Q7RTS5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
OTOP3Q7RTS5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
OTOP3Q7RTS5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
OTOP3Q7RTS5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
OTOP3Q7RTS5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
OTOP3Q7RTS5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
OTOP3Q7RTS5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
OTOP3Q7RTS5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
OTOP3Q7RTS5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
OTOP3Q7RTS5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
OTOP3Q7RTS5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
OTOP3Q7RTS5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
OTOP3Q7RTS5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
OTOP3Q7RTS5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
OTOP3Q7RTS5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
OTOP3Q7RTS5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
OTOP3Q7RTS5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
OTOP3Q7RTS5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
OTOP3Q7RTS5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
OTOP3Q7RTS5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
OTOP3Q7RTS5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
OTOP3Q7RTS5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
OTOP3Q7RTS5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
OTOP3Q7RTS5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
OTOP3Q7RTS5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
OTOP3Q7RTS5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
OTOP3Q7RTS5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
OTOP3Q7RTS5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
OTOP3Q7RTS5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
OTOP3Q7RTS5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
OTOP3Q7RTS5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
OTOP3Q7RTS5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
OTOP3Q7RTS5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
OTOP3Q7RTS5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
OTOP3Q7RTS5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
OTOP3Q7RTS5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
OTOP3Q7RTS5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
OTOP3Q7RTS5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
OTOP3Q7RTS5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
OTOP3Q7RTS5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
OTOP3Q7RTS5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
OTOP3Q7RTS5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
OTOP3Q7RTS5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
OTOP3Q7RTS5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
OTOP3Q7RTS5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
OTOP3Q7RTS5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
OTOP3Q7RTS5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
OTOP3Q7RTS5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
OTOP3Q7RTS5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
OTOP3Q7RTS5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
OTOP3Q7RTS5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
OTOP3Q7RTS5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
OTOP3Q7RTS5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
OTOP3Q7RTS5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
OTOP3Q7RTS5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
OTOP3Q7RTS5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
OTOP3Q7RTS5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
OTOP3Q7RTS5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
OTOP3Q7RTS5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
OTOP3Q7RTS5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
OTOP3Q7RTS5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
OTOP3Q7RTS5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
OTOP3Q7RTS5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
OTOP3Q7RTS5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
OTOP3Q7RTS5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
OTOP3Q7RTS5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
OTOP3Q7RTS5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
OTOP3Q7RTS5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
OTOP3Q7RTS5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
OTOP3Q7RTS5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
OTOP3Q7RTS5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
OTOP3Q7RTS5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
OTOP3Q7RTS5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
OTOP3Q7RTS5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
OTOP3Q7RTS5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
OTOP3Q7RTS5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
OTOP3Q7RTS5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
OTOP3Q7RTS5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms