Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
OTOP1Q7RTM1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
OTOP1Q7RTM1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
OTOP1Q7RTM1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
OTOP1Q7RTM1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
OTOP1Q7RTM1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
OTOP1Q7RTM1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
OTOP1Q7RTM1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
OTOP1Q7RTM1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
OTOP1Q7RTM1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
OTOP1Q7RTM1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
OTOP1Q7RTM1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
OTOP1Q7RTM1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
OTOP1Q7RTM1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
OTOP1Q7RTM1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
OTOP1Q7RTM1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
OTOP1Q7RTM1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
OTOP1Q7RTM1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
OTOP1Q7RTM1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
OTOP1Q7RTM1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
OTOP1Q7RTM1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
OTOP1Q7RTM1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
OTOP1Q7RTM1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
OTOP1Q7RTM1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
OTOP1Q7RTM1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
OTOP1Q7RTM1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
OTOP1Q7RTM1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
OTOP1Q7RTM1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
OTOP1Q7RTM1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
OTOP1Q7RTM1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
OTOP1Q7RTM1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
OTOP1Q7RTM1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
OTOP1Q7RTM1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.78■■■■□ 3
OTOP1Q7RTM1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
OTOP1Q7RTM1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
OTOP1Q7RTM1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
OTOP1Q7RTM1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
OTOP1Q7RTM1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
OTOP1Q7RTM1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
OTOP1Q7RTM1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
OTOP1Q7RTM1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
OTOP1Q7RTM1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
OTOP1Q7RTM1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
OTOP1Q7RTM1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
OTOP1Q7RTM1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
OTOP1Q7RTM1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
OTOP1Q7RTM1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
OTOP1Q7RTM1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
OTOP1Q7RTM1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
OTOP1Q7RTM1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
OTOP1Q7RTM1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
OTOP1Q7RTM1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
OTOP1Q7RTM1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
OTOP1Q7RTM1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
OTOP1Q7RTM1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
OTOP1Q7RTM1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
OTOP1Q7RTM1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
OTOP1Q7RTM1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
OTOP1Q7RTM1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
OTOP1Q7RTM1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
OTOP1Q7RTM1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
OTOP1Q7RTM1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
OTOP1Q7RTM1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
OTOP1Q7RTM1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
OTOP1Q7RTM1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
OTOP1Q7RTM1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
OTOP1Q7RTM1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
OTOP1Q7RTM1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
OTOP1Q7RTM1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
OTOP1Q7RTM1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
OTOP1Q7RTM1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
OTOP1Q7RTM1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
OTOP1Q7RTM1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
OTOP1Q7RTM1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
OTOP1Q7RTM1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
OTOP1Q7RTM1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
OTOP1Q7RTM1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
OTOP1Q7RTM1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
OTOP1Q7RTM1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
OTOP1Q7RTM1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
OTOP1Q7RTM1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
OTOP1Q7RTM1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
OTOP1Q7RTM1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
OTOP1Q7RTM1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
OTOP1Q7RTM1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
OTOP1Q7RTM1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
OTOP1Q7RTM1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
OTOP1Q7RTM1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
OTOP1Q7RTM1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
OTOP1Q7RTM1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
OTOP1Q7RTM1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
OTOP1Q7RTM1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
OTOP1Q7RTM1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
OTOP1Q7RTM1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
OTOP1Q7RTM1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
OTOP1Q7RTM1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
OTOP1Q7RTM1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
OTOP1Q7RTM1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
OTOP1Q7RTM1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
OTOP1Q7RTM1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms