Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMD2

SPNS3, Protein spinster homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3Q6ZMD2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPNS3Q6ZMD2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPNS3Q6ZMD2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPNS3Q6ZMD2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPNS3Q6ZMD2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPNS3Q6ZMD2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SPNS3Q6ZMD2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPNS3Q6ZMD2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPNS3Q6ZMD2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPNS3Q6ZMD2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPNS3Q6ZMD2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPNS3Q6ZMD2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPNS3Q6ZMD2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SPNS3Q6ZMD2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPNS3Q6ZMD2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPNS3Q6ZMD2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPNS3Q6ZMD2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPNS3Q6ZMD2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPNS3Q6ZMD2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPNS3Q6ZMD2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPNS3Q6ZMD2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPNS3Q6ZMD2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SPNS3Q6ZMD2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPNS3Q6ZMD2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPNS3Q6ZMD2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPNS3Q6ZMD2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPNS3Q6ZMD2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPNS3Q6ZMD2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SPNS3Q6ZMD2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPNS3Q6ZMD2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPNS3Q6ZMD2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPNS3Q6ZMD2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPNS3Q6ZMD2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPNS3Q6ZMD2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPNS3Q6ZMD2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPNS3Q6ZMD2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPNS3Q6ZMD2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPNS3Q6ZMD2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPNS3Q6ZMD2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPNS3Q6ZMD2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPNS3Q6ZMD2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPNS3Q6ZMD2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SPNS3Q6ZMD2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPNS3Q6ZMD2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPNS3Q6ZMD2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPNS3Q6ZMD2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPNS3Q6ZMD2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPNS3Q6ZMD2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPNS3Q6ZMD2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPNS3Q6ZMD2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPNS3Q6ZMD2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPNS3Q6ZMD2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPNS3Q6ZMD2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPNS3Q6ZMD2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPNS3Q6ZMD2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPNS3Q6ZMD2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPNS3Q6ZMD2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPNS3Q6ZMD2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPNS3Q6ZMD2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPNS3Q6ZMD2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPNS3Q6ZMD2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPNS3Q6ZMD2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPNS3Q6ZMD2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPNS3Q6ZMD2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPNS3Q6ZMD2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPNS3Q6ZMD2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPNS3Q6ZMD2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPNS3Q6ZMD2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPNS3Q6ZMD2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPNS3Q6ZMD2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPNS3Q6ZMD2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPNS3Q6ZMD2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPNS3Q6ZMD2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPNS3Q6ZMD2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPNS3Q6ZMD2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPNS3Q6ZMD2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPNS3Q6ZMD2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPNS3Q6ZMD2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPNS3Q6ZMD2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPNS3Q6ZMD2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPNS3Q6ZMD2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPNS3Q6ZMD2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPNS3Q6ZMD2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPNS3Q6ZMD2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPNS3Q6ZMD2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPNS3Q6ZMD2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPNS3Q6ZMD2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPNS3Q6ZMD2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPNS3Q6ZMD2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPNS3Q6ZMD2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPNS3Q6ZMD2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPNS3Q6ZMD2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPNS3Q6ZMD2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPNS3Q6ZMD2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPNS3Q6ZMD2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPNS3Q6ZMD2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPNS3Q6ZMD2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPNS3Q6ZMD2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPNS3Q6ZMD2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPNS3Q6ZMD2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms