Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D2

TREML2, Trem-like transcript 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML2Q5T2D2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
TREML2Q5T2D2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TREML2Q5T2D2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TREML2Q5T2D2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TREML2Q5T2D2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TREML2Q5T2D2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TREML2Q5T2D2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TREML2Q5T2D2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TREML2Q5T2D2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TREML2Q5T2D2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TREML2Q5T2D2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TREML2Q5T2D2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TREML2Q5T2D2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
TREML2Q5T2D2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TREML2Q5T2D2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TREML2Q5T2D2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TREML2Q5T2D2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TREML2Q5T2D2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TREML2Q5T2D2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TREML2Q5T2D2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TREML2Q5T2D2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TREML2Q5T2D2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TREML2Q5T2D2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
TREML2Q5T2D2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TREML2Q5T2D2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TREML2Q5T2D2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TREML2Q5T2D2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TREML2Q5T2D2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TREML2Q5T2D2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TREML2Q5T2D2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TREML2Q5T2D2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TREML2Q5T2D2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TREML2Q5T2D2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TREML2Q5T2D2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TREML2Q5T2D2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TREML2Q5T2D2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TREML2Q5T2D2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TREML2Q5T2D2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
TREML2Q5T2D2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TREML2Q5T2D2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TREML2Q5T2D2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TREML2Q5T2D2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
TREML2Q5T2D2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TREML2Q5T2D2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TREML2Q5T2D2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TREML2Q5T2D2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TREML2Q5T2D2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TREML2Q5T2D2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TREML2Q5T2D2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TREML2Q5T2D2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
TREML2Q5T2D2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TREML2Q5T2D2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TREML2Q5T2D2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TREML2Q5T2D2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TREML2Q5T2D2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TREML2Q5T2D2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TREML2Q5T2D2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TREML2Q5T2D2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TREML2Q5T2D2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TREML2Q5T2D2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TREML2Q5T2D2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TREML2Q5T2D2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TREML2Q5T2D2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TREML2Q5T2D2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TREML2Q5T2D2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TREML2Q5T2D2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TREML2Q5T2D2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TREML2Q5T2D2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TREML2Q5T2D2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TREML2Q5T2D2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
TREML2Q5T2D2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TREML2Q5T2D2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TREML2Q5T2D2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TREML2Q5T2D2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TREML2Q5T2D2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TREML2Q5T2D2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TREML2Q5T2D2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TREML2Q5T2D2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TREML2Q5T2D2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TREML2Q5T2D2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
TREML2Q5T2D2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TREML2Q5T2D2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TREML2Q5T2D2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TREML2Q5T2D2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TREML2Q5T2D2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TREML2Q5T2D2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TREML2Q5T2D2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TREML2Q5T2D2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TREML2Q5T2D2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TREML2Q5T2D2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TREML2Q5T2D2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TREML2Q5T2D2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TREML2Q5T2D2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
TREML2Q5T2D2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TREML2Q5T2D2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TREML2Q5T2D2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TREML2Q5T2D2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
TREML2Q5T2D2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
TREML2Q5T2D2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TREML2Q5T2D2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms