Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D2

TREML2, Trem-like transcript 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML2Q5T2D2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.4■■■■■ 4.06
TREML2Q5T2D2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
TREML2Q5T2D2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TREML2Q5T2D2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
TREML2Q5T2D2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
TREML2Q5T2D2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
TREML2Q5T2D2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
TREML2Q5T2D2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
TREML2Q5T2D2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TREML2Q5T2D2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
TREML2Q5T2D2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TREML2Q5T2D2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TREML2Q5T2D2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TREML2Q5T2D2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
TREML2Q5T2D2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
TREML2Q5T2D2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TREML2Q5T2D2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TREML2Q5T2D2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TREML2Q5T2D2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TREML2Q5T2D2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TREML2Q5T2D2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TREML2Q5T2D2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TREML2Q5T2D2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TREML2Q5T2D2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
TREML2Q5T2D2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TREML2Q5T2D2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TREML2Q5T2D2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TREML2Q5T2D2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TREML2Q5T2D2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TREML2Q5T2D2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
TREML2Q5T2D2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TREML2Q5T2D2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TREML2Q5T2D2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TREML2Q5T2D2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TREML2Q5T2D2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
TREML2Q5T2D2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
TREML2Q5T2D2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
TREML2Q5T2D2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TREML2Q5T2D2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
TREML2Q5T2D2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TREML2Q5T2D2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TREML2Q5T2D2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TREML2Q5T2D2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
TREML2Q5T2D2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TREML2Q5T2D2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
TREML2Q5T2D2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TREML2Q5T2D2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TREML2Q5T2D2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TREML2Q5T2D2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TREML2Q5T2D2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TREML2Q5T2D2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
TREML2Q5T2D2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TREML2Q5T2D2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TREML2Q5T2D2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TREML2Q5T2D2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TREML2Q5T2D2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TREML2Q5T2D2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TREML2Q5T2D2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TREML2Q5T2D2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TREML2Q5T2D2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TREML2Q5T2D2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TREML2Q5T2D2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
TREML2Q5T2D2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TREML2Q5T2D2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TREML2Q5T2D2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TREML2Q5T2D2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TREML2Q5T2D2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TREML2Q5T2D2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TREML2Q5T2D2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TREML2Q5T2D2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TREML2Q5T2D2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TREML2Q5T2D2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TREML2Q5T2D2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TREML2Q5T2D2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TREML2Q5T2D2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TREML2Q5T2D2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TREML2Q5T2D2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TREML2Q5T2D2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TREML2Q5T2D2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TREML2Q5T2D2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TREML2Q5T2D2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
TREML2Q5T2D2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TREML2Q5T2D2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TREML2Q5T2D2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TREML2Q5T2D2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TREML2Q5T2D2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TREML2Q5T2D2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TREML2Q5T2D2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TREML2Q5T2D2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TREML2Q5T2D2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
TREML2Q5T2D2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TREML2Q5T2D2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TREML2Q5T2D2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TREML2Q5T2D2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
TREML2Q5T2D2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TREML2Q5T2D2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TREML2Q5T2D2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TREML2Q5T2D2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TREML2Q5T2D2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TREML2Q5T2D2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms