Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MIA3Q5JRA6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MIA3Q5JRA6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MIA3Q5JRA6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MIA3Q5JRA6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MIA3Q5JRA6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MIA3Q5JRA6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MIA3Q5JRA6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MIA3Q5JRA6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MIA3Q5JRA6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MIA3Q5JRA6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MIA3Q5JRA6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MIA3Q5JRA6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MIA3Q5JRA6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MIA3Q5JRA6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MIA3Q5JRA6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
MIA3Q5JRA6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MIA3Q5JRA6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MIA3Q5JRA6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MIA3Q5JRA6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
MIA3Q5JRA6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MIA3Q5JRA6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MIA3Q5JRA6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MIA3Q5JRA6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MIA3Q5JRA6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MIA3Q5JRA6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MIA3Q5JRA6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MIA3Q5JRA6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MIA3Q5JRA6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
MIA3Q5JRA6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MIA3Q5JRA6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MIA3Q5JRA6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MIA3Q5JRA6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MIA3Q5JRA6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MIA3Q5JRA6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MIA3Q5JRA6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MIA3Q5JRA6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MIA3Q5JRA6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MIA3Q5JRA6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MIA3Q5JRA6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MIA3Q5JRA6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MIA3Q5JRA6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MIA3Q5JRA6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MIA3Q5JRA6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MIA3Q5JRA6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MIA3Q5JRA6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MIA3Q5JRA6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MIA3Q5JRA6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MIA3Q5JRA6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MIA3Q5JRA6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
MIA3Q5JRA6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MIA3Q5JRA6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MIA3Q5JRA6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
MIA3Q5JRA6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MIA3Q5JRA6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MIA3Q5JRA6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
MIA3Q5JRA6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MIA3Q5JRA6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MIA3Q5JRA6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MIA3Q5JRA6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
MIA3Q5JRA6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MIA3Q5JRA6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MIA3Q5JRA6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MIA3Q5JRA6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MIA3Q5JRA6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MIA3Q5JRA6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MIA3Q5JRA6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MIA3Q5JRA6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MIA3Q5JRA6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MIA3Q5JRA6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MIA3Q5JRA6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MIA3Q5JRA6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MIA3Q5JRA6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MIA3Q5JRA6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MIA3Q5JRA6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MIA3Q5JRA6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MIA3Q5JRA6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MIA3Q5JRA6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
MIA3Q5JRA6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MIA3Q5JRA6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MIA3Q5JRA6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
MIA3Q5JRA6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MIA3Q5JRA6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MIA3Q5JRA6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MIA3Q5JRA6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MIA3Q5JRA6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MIA3Q5JRA6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
MIA3Q5JRA6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MIA3Q5JRA6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MIA3Q5JRA6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MIA3Q5JRA6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MIA3Q5JRA6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MIA3Q5JRA6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MIA3Q5JRA6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MIA3Q5JRA6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MIA3Q5JRA6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MIA3Q5JRA6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MIA3Q5JRA6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MIA3Q5JRA6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MIA3Q5JRA6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms