Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDK2Q58EX2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDK2Q58EX2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDK2Q58EX2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SDK2Q58EX2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SDK2Q58EX2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SDK2Q58EX2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SDK2Q58EX2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDK2Q58EX2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDK2Q58EX2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SDK2Q58EX2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SDK2Q58EX2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SDK2Q58EX2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
SDK2Q58EX2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SDK2Q58EX2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SDK2Q58EX2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SDK2Q58EX2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SDK2Q58EX2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SDK2Q58EX2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SDK2Q58EX2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDK2Q58EX2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SDK2Q58EX2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SDK2Q58EX2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SDK2Q58EX2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SDK2Q58EX2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SDK2Q58EX2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SDK2Q58EX2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SDK2Q58EX2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SDK2Q58EX2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SDK2Q58EX2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDK2Q58EX2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SDK2Q58EX2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDK2Q58EX2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDK2Q58EX2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SDK2Q58EX2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SDK2Q58EX2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SDK2Q58EX2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SDK2Q58EX2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SDK2Q58EX2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDK2Q58EX2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDK2Q58EX2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDK2Q58EX2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDK2Q58EX2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SDK2Q58EX2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SDK2Q58EX2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDK2Q58EX2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDK2Q58EX2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDK2Q58EX2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDK2Q58EX2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SDK2Q58EX2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SDK2Q58EX2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDK2Q58EX2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SDK2Q58EX2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SDK2Q58EX2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDK2Q58EX2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDK2Q58EX2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDK2Q58EX2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDK2Q58EX2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SDK2Q58EX2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDK2Q58EX2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SDK2Q58EX2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDK2Q58EX2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDK2Q58EX2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDK2Q58EX2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDK2Q58EX2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDK2Q58EX2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SDK2Q58EX2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDK2Q58EX2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SDK2Q58EX2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDK2Q58EX2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SDK2Q58EX2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SDK2Q58EX2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SDK2Q58EX2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SDK2Q58EX2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDK2Q58EX2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDK2Q58EX2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDK2Q58EX2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDK2Q58EX2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDK2Q58EX2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SDK2Q58EX2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDK2Q58EX2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDK2Q58EX2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDK2Q58EX2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDK2Q58EX2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDK2Q58EX2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDK2Q58EX2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDK2Q58EX2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDK2Q58EX2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDK2Q58EX2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDK2Q58EX2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SDK2Q58EX2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDK2Q58EX2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDK2Q58EX2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SDK2Q58EX2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SDK2Q58EX2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SDK2Q58EX2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SDK2Q58EX2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SDK2Q58EX2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SDK2Q58EX2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SDK2Q58EX2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms