Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SLFNL1Q499Z3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SLFNL1Q499Z3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SLFNL1Q499Z3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SLFNL1Q499Z3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SLFNL1Q499Z3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SLFNL1Q499Z3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
SLFNL1Q499Z3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SLFNL1Q499Z3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
SLFNL1Q499Z3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SLFNL1Q499Z3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
SLFNL1Q499Z3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
SLFNL1Q499Z3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
SLFNL1Q499Z3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
SLFNL1Q499Z3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
SLFNL1Q499Z3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SLFNL1Q499Z3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SLFNL1Q499Z3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SLFNL1Q499Z3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
SLFNL1Q499Z3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
SLFNL1Q499Z3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SLFNL1Q499Z3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SLFNL1Q499Z3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SLFNL1Q499Z3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SLFNL1Q499Z3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SLFNL1Q499Z3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SLFNL1Q499Z3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SLFNL1Q499Z3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SLFNL1Q499Z3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
SLFNL1Q499Z3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SLFNL1Q499Z3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SLFNL1Q499Z3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SLFNL1Q499Z3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SLFNL1Q499Z3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SLFNL1Q499Z3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SLFNL1Q499Z3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SLFNL1Q499Z3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SLFNL1Q499Z3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SLFNL1Q499Z3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SLFNL1Q499Z3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SLFNL1Q499Z3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SLFNL1Q499Z3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SLFNL1Q499Z3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SLFNL1Q499Z3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SLFNL1Q499Z3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SLFNL1Q499Z3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SLFNL1Q499Z3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SLFNL1Q499Z3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SLFNL1Q499Z3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SLFNL1Q499Z3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SLFNL1Q499Z3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SLFNL1Q499Z3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SLFNL1Q499Z3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SLFNL1Q499Z3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SLFNL1Q499Z3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SLFNL1Q499Z3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SLFNL1Q499Z3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SLFNL1Q499Z3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SLFNL1Q499Z3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SLFNL1Q499Z3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SLFNL1Q499Z3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SLFNL1Q499Z3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SLFNL1Q499Z3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SLFNL1Q499Z3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SLFNL1Q499Z3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SLFNL1Q499Z3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SLFNL1Q499Z3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SLFNL1Q499Z3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SLFNL1Q499Z3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SLFNL1Q499Z3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SLFNL1Q499Z3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SLFNL1Q499Z3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SLFNL1Q499Z3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SLFNL1Q499Z3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SLFNL1Q499Z3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SLFNL1Q499Z3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SLFNL1Q499Z3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SLFNL1Q499Z3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SLFNL1Q499Z3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SLFNL1Q499Z3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SLFNL1Q499Z3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SLFNL1Q499Z3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SLFNL1Q499Z3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SLFNL1Q499Z3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SLFNL1Q499Z3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SLFNL1Q499Z3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SLFNL1Q499Z3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SLFNL1Q499Z3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SLFNL1Q499Z3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SLFNL1Q499Z3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SLFNL1Q499Z3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SLFNL1Q499Z3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SLFNL1Q499Z3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SLFNL1Q499Z3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLFNL1Q499Z3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLFNL1Q499Z3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLFNL1Q499Z3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLFNL1Q499Z3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLFNL1Q499Z3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLFNL1Q499Z3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms