Protein–RNA interactions for Protein: Q3Y452

TDRG1, Testis development-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRG1Q3Y452 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRG1Q3Y452 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRG1Q3Y452 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TDRG1Q3Y452 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TDRG1Q3Y452 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TDRG1Q3Y452 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRG1Q3Y452 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRG1Q3Y452 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRG1Q3Y452 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDRG1Q3Y452 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TDRG1Q3Y452 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRG1Q3Y452 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TDRG1Q3Y452 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TDRG1Q3Y452 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDRG1Q3Y452 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TDRG1Q3Y452 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TDRG1Q3Y452 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRG1Q3Y452 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TDRG1Q3Y452 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRG1Q3Y452 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TDRG1Q3Y452 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TDRG1Q3Y452 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRG1Q3Y452 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRG1Q3Y452 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TDRG1Q3Y452 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRG1Q3Y452 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRG1Q3Y452 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRG1Q3Y452 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TDRG1Q3Y452 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TDRG1Q3Y452 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TDRG1Q3Y452 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TDRG1Q3Y452 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRG1Q3Y452 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TDRG1Q3Y452 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TDRG1Q3Y452 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRG1Q3Y452 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TDRG1Q3Y452 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRG1Q3Y452 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TDRG1Q3Y452 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRG1Q3Y452 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRG1Q3Y452 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRG1Q3Y452 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRG1Q3Y452 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRG1Q3Y452 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRG1Q3Y452 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TDRG1Q3Y452 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TDRG1Q3Y452 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TDRG1Q3Y452 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRG1Q3Y452 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TDRG1Q3Y452 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TDRG1Q3Y452 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TDRG1Q3Y452 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TDRG1Q3Y452 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TDRG1Q3Y452 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRG1Q3Y452 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRG1Q3Y452 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TDRG1Q3Y452 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TDRG1Q3Y452 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TDRG1Q3Y452 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRG1Q3Y452 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TDRG1Q3Y452 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRG1Q3Y452 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TDRG1Q3Y452 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TDRG1Q3Y452 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRG1Q3Y452 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TDRG1Q3Y452 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TDRG1Q3Y452 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRG1Q3Y452 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TDRG1Q3Y452 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRG1Q3Y452 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TDRG1Q3Y452 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRG1Q3Y452 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TDRG1Q3Y452 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRG1Q3Y452 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRG1Q3Y452 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRG1Q3Y452 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRG1Q3Y452 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRG1Q3Y452 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRG1Q3Y452 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRG1Q3Y452 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRG1Q3Y452 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRG1Q3Y452 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRG1Q3Y452 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRG1Q3Y452 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRG1Q3Y452 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TDRG1Q3Y452 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRG1Q3Y452 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRG1Q3Y452 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TDRG1Q3Y452 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRG1Q3Y452 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TDRG1Q3Y452 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TDRG1Q3Y452 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRG1Q3Y452 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TDRG1Q3Y452 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRG1Q3Y452 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TDRG1Q3Y452 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRG1Q3Y452 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRG1Q3Y452 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TDRG1Q3Y452 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TDRG1Q3Y452 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms