Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LAMA4Q16363 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LAMA4Q16363 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LAMA4Q16363 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LAMA4Q16363 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LAMA4Q16363 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
LAMA4Q16363 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LAMA4Q16363 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
LAMA4Q16363 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
LAMA4Q16363 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LAMA4Q16363 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LAMA4Q16363 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
LAMA4Q16363 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LAMA4Q16363 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LAMA4Q16363 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMA4Q16363 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMA4Q16363 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LAMA4Q16363 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LAMA4Q16363 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LAMA4Q16363 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
LAMA4Q16363 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
LAMA4Q16363 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LAMA4Q16363 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LAMA4Q16363 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LAMA4Q16363 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LAMA4Q16363 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LAMA4Q16363 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMA4Q16363 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LAMA4Q16363 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
LAMA4Q16363 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
LAMA4Q16363 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LAMA4Q16363 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LAMA4Q16363 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMA4Q16363 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
LAMA4Q16363 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMA4Q16363 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMA4Q16363 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LAMA4Q16363 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LAMA4Q16363 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LAMA4Q16363 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LAMA4Q16363 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LAMA4Q16363 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMA4Q16363 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LAMA4Q16363 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LAMA4Q16363 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LAMA4Q16363 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LAMA4Q16363 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LAMA4Q16363 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
LAMA4Q16363 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LAMA4Q16363 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LAMA4Q16363 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LAMA4Q16363 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LAMA4Q16363 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LAMA4Q16363 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LAMA4Q16363 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LAMA4Q16363 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LAMA4Q16363 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LAMA4Q16363 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LAMA4Q16363 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LAMA4Q16363 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LAMA4Q16363 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LAMA4Q16363 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LAMA4Q16363 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LAMA4Q16363 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LAMA4Q16363 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LAMA4Q16363 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMA4Q16363 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMA4Q16363 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMA4Q16363 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
LAMA4Q16363 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LAMA4Q16363 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LAMA4Q16363 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMA4Q16363 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LAMA4Q16363 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMA4Q16363 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMA4Q16363 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LAMA4Q16363 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LAMA4Q16363 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
LAMA4Q16363 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LAMA4Q16363 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LAMA4Q16363 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LAMA4Q16363 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LAMA4Q16363 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LAMA4Q16363 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMA4Q16363 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LAMA4Q16363 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LAMA4Q16363 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMA4Q16363 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LAMA4Q16363 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
LAMA4Q16363 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LAMA4Q16363 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LAMA4Q16363 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LAMA4Q16363 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LAMA4Q16363 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
LAMA4Q16363 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LAMA4Q16363 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LAMA4Q16363 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LAMA4Q16363 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LAMA4Q16363 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
LAMA4Q16363 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.2 ms