Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
LAMA4Q16363 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
LAMA4Q16363 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.63■■■■□ 3.93
LAMA4Q16363 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
LAMA4Q16363 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
LAMA4Q16363 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
LAMA4Q16363 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
LAMA4Q16363 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
LAMA4Q16363 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
LAMA4Q16363 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
LAMA4Q16363 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
LAMA4Q16363 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
LAMA4Q16363 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
LAMA4Q16363 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
LAMA4Q16363 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
LAMA4Q16363 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LAMA4Q16363 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
LAMA4Q16363 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LAMA4Q16363 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
LAMA4Q16363 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
LAMA4Q16363 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LAMA4Q16363 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
LAMA4Q16363 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
LAMA4Q16363 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
LAMA4Q16363 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
LAMA4Q16363 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
LAMA4Q16363 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
LAMA4Q16363 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
LAMA4Q16363 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
LAMA4Q16363 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
LAMA4Q16363 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
LAMA4Q16363 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
LAMA4Q16363 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
LAMA4Q16363 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
LAMA4Q16363 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
LAMA4Q16363 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
LAMA4Q16363 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
LAMA4Q16363 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
LAMA4Q16363 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
LAMA4Q16363 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LAMA4Q16363 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
LAMA4Q16363 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
LAMA4Q16363 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LAMA4Q16363 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
LAMA4Q16363 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LAMA4Q16363 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
LAMA4Q16363 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
LAMA4Q16363 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LAMA4Q16363 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LAMA4Q16363 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
LAMA4Q16363 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
LAMA4Q16363 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
LAMA4Q16363 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
LAMA4Q16363 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
LAMA4Q16363 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LAMA4Q16363 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LAMA4Q16363 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LAMA4Q16363 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
LAMA4Q16363 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
LAMA4Q16363 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LAMA4Q16363 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LAMA4Q16363 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LAMA4Q16363 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
LAMA4Q16363 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
LAMA4Q16363 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
LAMA4Q16363 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
LAMA4Q16363 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LAMA4Q16363 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LAMA4Q16363 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
LAMA4Q16363 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
LAMA4Q16363 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LAMA4Q16363 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
LAMA4Q16363 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LAMA4Q16363 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
LAMA4Q16363 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
LAMA4Q16363 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LAMA4Q16363 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LAMA4Q16363 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
LAMA4Q16363 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
LAMA4Q16363 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
LAMA4Q16363 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
LAMA4Q16363 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
LAMA4Q16363 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LAMA4Q16363 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LAMA4Q16363 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LAMA4Q16363 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
LAMA4Q16363 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
LAMA4Q16363 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
LAMA4Q16363 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LAMA4Q16363 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LAMA4Q16363 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LAMA4Q16363 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LAMA4Q16363 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LAMA4Q16363 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LAMA4Q16363 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
LAMA4Q16363 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
LAMA4Q16363 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LAMA4Q16363 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LAMA4Q16363 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LAMA4Q16363 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
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