Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USF2Q15853 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USF2Q15853 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USF2Q15853 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USF2Q15853 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USF2Q15853 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USF2Q15853 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USF2Q15853 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USF2Q15853 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USF2Q15853 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USF2Q15853 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USF2Q15853 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USF2Q15853 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USF2Q15853 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USF2Q15853 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USF2Q15853 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USF2Q15853 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USF2Q15853 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USF2Q15853 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USF2Q15853 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USF2Q15853 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USF2Q15853 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USF2Q15853 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USF2Q15853 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USF2Q15853 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USF2Q15853 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USF2Q15853 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USF2Q15853 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USF2Q15853 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USF2Q15853 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USF2Q15853 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USF2Q15853 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USF2Q15853 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USF2Q15853 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USF2Q15853 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USF2Q15853 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USF2Q15853 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USF2Q15853 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USF2Q15853 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USF2Q15853 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USF2Q15853 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USF2Q15853 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USF2Q15853 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USF2Q15853 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USF2Q15853 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USF2Q15853 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USF2Q15853 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USF2Q15853 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USF2Q15853 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
USF2Q15853 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USF2Q15853 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USF2Q15853 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USF2Q15853 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USF2Q15853 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USF2Q15853 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USF2Q15853 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USF2Q15853 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USF2Q15853 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USF2Q15853 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USF2Q15853 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USF2Q15853 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USF2Q15853 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USF2Q15853 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USF2Q15853 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USF2Q15853 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USF2Q15853 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USF2Q15853 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USF2Q15853 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USF2Q15853 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USF2Q15853 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USF2Q15853 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USF2Q15853 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USF2Q15853 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USF2Q15853 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USF2Q15853 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USF2Q15853 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USF2Q15853 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USF2Q15853 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USF2Q15853 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USF2Q15853 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USF2Q15853 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USF2Q15853 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USF2Q15853 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USF2Q15853 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USF2Q15853 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USF2Q15853 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USF2Q15853 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USF2Q15853 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USF2Q15853 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USF2Q15853 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USF2Q15853 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USF2Q15853 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USF2Q15853 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USF2Q15853 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USF2Q15853 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USF2Q15853 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USF2Q15853 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USF2Q15853 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USF2Q15853 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USF2Q15853 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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