Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USF2Q15853 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USF2Q15853 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USF2Q15853 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USF2Q15853 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
USF2Q15853 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USF2Q15853 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USF2Q15853 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USF2Q15853 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USF2Q15853 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USF2Q15853 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USF2Q15853 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USF2Q15853 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USF2Q15853 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USF2Q15853 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USF2Q15853 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USF2Q15853 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USF2Q15853 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USF2Q15853 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USF2Q15853 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USF2Q15853 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USF2Q15853 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USF2Q15853 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USF2Q15853 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USF2Q15853 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USF2Q15853 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USF2Q15853 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USF2Q15853 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USF2Q15853 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USF2Q15853 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USF2Q15853 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USF2Q15853 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USF2Q15853 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USF2Q15853 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USF2Q15853 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USF2Q15853 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USF2Q15853 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USF2Q15853 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USF2Q15853 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USF2Q15853 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USF2Q15853 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USF2Q15853 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USF2Q15853 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USF2Q15853 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USF2Q15853 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USF2Q15853 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USF2Q15853 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USF2Q15853 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USF2Q15853 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USF2Q15853 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USF2Q15853 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USF2Q15853 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USF2Q15853 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USF2Q15853 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USF2Q15853 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USF2Q15853 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USF2Q15853 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USF2Q15853 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USF2Q15853 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USF2Q15853 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USF2Q15853 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USF2Q15853 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USF2Q15853 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USF2Q15853 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USF2Q15853 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USF2Q15853 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USF2Q15853 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USF2Q15853 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USF2Q15853 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USF2Q15853 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USF2Q15853 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USF2Q15853 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USF2Q15853 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USF2Q15853 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USF2Q15853 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USF2Q15853 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USF2Q15853 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USF2Q15853 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USF2Q15853 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USF2Q15853 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USF2Q15853 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USF2Q15853 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USF2Q15853 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USF2Q15853 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USF2Q15853 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USF2Q15853 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USF2Q15853 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USF2Q15853 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USF2Q15853 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USF2Q15853 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USF2Q15853 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USF2Q15853 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USF2Q15853 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USF2Q15853 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USF2Q15853 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USF2Q15853 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USF2Q15853 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USF2Q15853 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USF2Q15853 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USF2Q15853 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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