Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SHPRHQ149N8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SHPRHQ149N8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SHPRHQ149N8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
SHPRHQ149N8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
SHPRHQ149N8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.17■■■■■ 4.18
SHPRHQ149N8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
SHPRHQ149N8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
SHPRHQ149N8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC41.12■■■■■ 4.17
SHPRHQ149N8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
SHPRHQ149N8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
SHPRHQ149N8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
SHPRHQ149N8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
SHPRHQ149N8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
SHPRHQ149N8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
SHPRHQ149N8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
SHPRHQ149N8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SHPRHQ149N8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
SHPRHQ149N8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
SHPRHQ149N8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
SHPRHQ149N8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
SHPRHQ149N8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
SHPRHQ149N8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SHPRHQ149N8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
SHPRHQ149N8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SHPRHQ149N8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SHPRHQ149N8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
SHPRHQ149N8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
SHPRHQ149N8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SHPRHQ149N8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SHPRHQ149N8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SHPRHQ149N8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SHPRHQ149N8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SHPRHQ149N8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SHPRHQ149N8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
SHPRHQ149N8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SHPRHQ149N8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SHPRHQ149N8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
SHPRHQ149N8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SHPRHQ149N8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
SHPRHQ149N8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SHPRHQ149N8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SHPRHQ149N8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SHPRHQ149N8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SHPRHQ149N8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
SHPRHQ149N8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SHPRHQ149N8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
SHPRHQ149N8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SHPRHQ149N8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SHPRHQ149N8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
SHPRHQ149N8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SHPRHQ149N8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SHPRHQ149N8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SHPRHQ149N8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SHPRHQ149N8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SHPRHQ149N8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SHPRHQ149N8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SHPRHQ149N8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SHPRHQ149N8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
SHPRHQ149N8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SHPRHQ149N8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
SHPRHQ149N8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
SHPRHQ149N8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
SHPRHQ149N8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
SHPRHQ149N8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
SHPRHQ149N8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
SHPRHQ149N8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SHPRHQ149N8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
SHPRHQ149N8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
SHPRHQ149N8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SHPRHQ149N8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
SHPRHQ149N8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SHPRHQ149N8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
SHPRHQ149N8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
SHPRHQ149N8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
SHPRHQ149N8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
SHPRHQ149N8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
SHPRHQ149N8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
SHPRHQ149N8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
SHPRHQ149N8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
SHPRHQ149N8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
SHPRHQ149N8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
SHPRHQ149N8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
SHPRHQ149N8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
SHPRHQ149N8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SHPRHQ149N8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SHPRHQ149N8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
SHPRHQ149N8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SHPRHQ149N8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
SHPRHQ149N8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
SHPRHQ149N8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
SHPRHQ149N8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
SHPRHQ149N8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SHPRHQ149N8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
SHPRHQ149N8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
SHPRHQ149N8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
SHPRHQ149N8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
SHPRHQ149N8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.91
SHPRHQ149N8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
SHPRHQ149N8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC39.5■■■■□ 3.91
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