Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
CDK13Q14004 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.21■■■■■ 4.99
CDK13Q14004 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
CDK13Q14004 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
CDK13Q14004 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
CDK13Q14004 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
CDK13Q14004 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC46.13■■■■■ 4.97
CDK13Q14004 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC46.05■■■■■ 4.96
CDK13Q14004 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
CDK13Q14004 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC46■■■■■ 4.95
CDK13Q14004 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
CDK13Q14004 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.96■■■■■ 4.95
CDK13Q14004 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
CDK13Q14004 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
CDK13Q14004 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC45.91■■■■■ 4.94
CDK13Q14004 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC45.87■■■■■ 4.93
CDK13Q14004 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
CDK13Q14004 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
CDK13Q14004 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
CDK13Q14004 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
CDK13Q14004 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.73■■■■■ 4.91
CDK13Q14004 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
CDK13Q14004 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
CDK13Q14004 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
CDK13Q14004 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC45.66■■■■■ 4.9
CDK13Q14004 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
CDK13Q14004 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.57■■■■■ 4.88
CDK13Q14004 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC45.56■■■■■ 4.88
CDK13Q14004 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC45.49■■■■■ 4.87
CDK13Q14004 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC45.49■■■■■ 4.87
CDK13Q14004 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC45.48■■■■■ 4.87
CDK13Q14004 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.47■■■■■ 4.87
CDK13Q14004 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
CDK13Q14004 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
CDK13Q14004 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC45.42■■■■■ 4.86
CDK13Q14004 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
CDK13Q14004 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC45.41■■■■■ 4.86
CDK13Q14004 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
CDK13Q14004 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
CDK13Q14004 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
CDK13Q14004 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC45.27■■■■■ 4.84
CDK13Q14004 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC45.24■■■■■ 4.83
CDK13Q14004 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
CDK13Q14004 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
CDK13Q14004 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
CDK13Q14004 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
CDK13Q14004 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
CDK13Q14004 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.82
CDK13Q14004 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
CDK13Q14004 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC45.16■■■■■ 4.82
CDK13Q14004 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC45.16■■■■■ 4.82
CDK13Q14004 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
CDK13Q14004 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
CDK13Q14004 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
CDK13Q14004 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
CDK13Q14004 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CDK13Q14004 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
CDK13Q14004 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC45.07■■■■■ 4.81
CDK13Q14004 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
CDK13Q14004 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC44.98■■■■■ 4.79
CDK13Q14004 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
CDK13Q14004 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
CDK13Q14004 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC44.93■■■■■ 4.78
CDK13Q14004 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
CDK13Q14004 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
CDK13Q14004 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
CDK13Q14004 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
CDK13Q14004 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
CDK13Q14004 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
CDK13Q14004 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC44.82■■■■■ 4.77
CDK13Q14004 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
CDK13Q14004 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
CDK13Q14004 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
CDK13Q14004 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
CDK13Q14004 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.62■■■■■ 4.73
CDK13Q14004 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
CDK13Q14004 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
CDK13Q14004 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
CDK13Q14004 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CDK13Q14004 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
CDK13Q14004 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.49■■■■■ 4.71
CDK13Q14004 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC44.47■■■■■ 4.71
CDK13Q14004 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
CDK13Q14004 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
CDK13Q14004 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
CDK13Q14004 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
CDK13Q14004 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
CDK13Q14004 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
CDK13Q14004 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
CDK13Q14004 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC44.41■■■■■ 4.7
CDK13Q14004 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC44.4■■■■■ 4.7
CDK13Q14004 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
CDK13Q14004 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
CDK13Q14004 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
CDK13Q14004 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
CDK13Q14004 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC44.38■■■■■ 4.69
CDK13Q14004 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
CDK13Q14004 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
CDK13Q14004 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC44.37■■■■■ 4.69
CDK13Q14004 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
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