Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
PKD2Q13563 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
PKD2Q13563 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
PKD2Q13563 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
PKD2Q13563 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC43.59■■■■■ 4.57
PKD2Q13563 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
PKD2Q13563 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
PKD2Q13563 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.58■■■■■ 4.57
PKD2Q13563 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
PKD2Q13563 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
PKD2Q13563 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC43.53■■■■■ 4.56
PKD2Q13563 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
PKD2Q13563 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
PKD2Q13563 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
PKD2Q13563 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
PKD2Q13563 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC43.45■■■■■ 4.55
PKD2Q13563 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
PKD2Q13563 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC43.44■■■■■ 4.54
PKD2Q13563 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
PKD2Q13563 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
PKD2Q13563 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
PKD2Q13563 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
PKD2Q13563 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
PKD2Q13563 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
PKD2Q13563 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
PKD2Q13563 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
PKD2Q13563 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
PKD2Q13563 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
PKD2Q13563 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
PKD2Q13563 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
PKD2Q13563 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
PKD2Q13563 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
PKD2Q13563 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
PKD2Q13563 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
PKD2Q13563 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
PKD2Q13563 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
PKD2Q13563 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
PKD2Q13563 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
PKD2Q13563 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC42.85■■■■■ 4.45
PKD2Q13563 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
PKD2Q13563 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
PKD2Q13563 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
PKD2Q13563 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
PKD2Q13563 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.41
PKD2Q13563 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
PKD2Q13563 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
PKD2Q13563 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
PKD2Q13563 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
PKD2Q13563 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
PKD2Q13563 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
PKD2Q13563 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
PKD2Q13563 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
PKD2Q13563 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
PKD2Q13563 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
PKD2Q13563 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
PKD2Q13563 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
PKD2Q13563 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
PKD2Q13563 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
PKD2Q13563 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
PKD2Q13563 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
PKD2Q13563 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.42■■■■■ 4.38
PKD2Q13563 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
PKD2Q13563 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
PKD2Q13563 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
PKD2Q13563 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
PKD2Q13563 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PKD2Q13563 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PKD2Q13563 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
PKD2Q13563 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
PKD2Q13563 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC42.27■■■■■ 4.36
PKD2Q13563 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
PKD2Q13563 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
PKD2Q13563 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
PKD2Q13563 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
PKD2Q13563 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
PKD2Q13563 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
PKD2Q13563 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
PKD2Q13563 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
PKD2Q13563 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
PKD2Q13563 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
PKD2Q13563 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
PKD2Q13563 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
PKD2Q13563 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
PKD2Q13563 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
PKD2Q13563 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
PKD2Q13563 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
PKD2Q13563 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
PKD2Q13563 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
PKD2Q13563 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
PKD2Q13563 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
PKD2Q13563 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
PKD2Q13563 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
PKD2Q13563 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
PKD2Q13563 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
PKD2Q13563 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
PKD2Q13563 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
PKD2Q13563 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
PKD2Q13563 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
PKD2Q13563 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
PKD2Q13563 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
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