Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF3C1Q12789 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF3C1Q12789 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF3C1Q12789 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF3C1Q12789 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF3C1Q12789 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C1Q12789 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF3C1Q12789 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C1Q12789 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C1Q12789 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C1Q12789 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF3C1Q12789 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C1Q12789 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C1Q12789 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C1Q12789 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C1Q12789 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C1Q12789 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C1Q12789 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C1Q12789 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
GTF3C1Q12789 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C1Q12789 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C1Q12789 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C1Q12789 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C1Q12789 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C1Q12789 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C1Q12789 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C1Q12789 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C1Q12789 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF3C1Q12789 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C1Q12789 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C1Q12789 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GTF3C1Q12789 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GTF3C1Q12789 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF3C1Q12789 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF3C1Q12789 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C1Q12789 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C1Q12789 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C1Q12789 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C1Q12789 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C1Q12789 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C1Q12789 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C1Q12789 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C1Q12789 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF3C1Q12789 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF3C1Q12789 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF3C1Q12789 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF3C1Q12789 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF3C1Q12789 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF3C1Q12789 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF3C1Q12789 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C1Q12789 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C1Q12789 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF3C1Q12789 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C1Q12789 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C1Q12789 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF3C1Q12789 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF3C1Q12789 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF3C1Q12789 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C1Q12789 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C1Q12789 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF3C1Q12789 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF3C1Q12789 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C1Q12789 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C1Q12789 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF3C1Q12789 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C1Q12789 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C1Q12789 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C1Q12789 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C1Q12789 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C1Q12789 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C1Q12789 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C1Q12789 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C1Q12789 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C1Q12789 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C1Q12789 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C1Q12789 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C1Q12789 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C1Q12789 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C1Q12789 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C1Q12789 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C1Q12789 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C1Q12789 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C1Q12789 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C1Q12789 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF3C1Q12789 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C1Q12789 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C1Q12789 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C1Q12789 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C1Q12789 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C1Q12789 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C1Q12789 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C1Q12789 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C1Q12789 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C1Q12789 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C1Q12789 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C1Q12789 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C1Q12789 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C1Q12789 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C1Q12789 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C1Q12789 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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