Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CPSF1Q10570 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CPSF1Q10570 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CPSF1Q10570 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CPSF1Q10570 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CPSF1Q10570 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CPSF1Q10570 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
CPSF1Q10570 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
CPSF1Q10570 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CPSF1Q10570 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CPSF1Q10570 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CPSF1Q10570 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CPSF1Q10570 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CPSF1Q10570 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CPSF1Q10570 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CPSF1Q10570 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CPSF1Q10570 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CPSF1Q10570 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.84■■■■□ 3.97
CPSF1Q10570 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CPSF1Q10570 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
CPSF1Q10570 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CPSF1Q10570 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CPSF1Q10570 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
CPSF1Q10570 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
CPSF1Q10570 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
CPSF1Q10570 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
CPSF1Q10570 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
CPSF1Q10570 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
CPSF1Q10570 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
CPSF1Q10570 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CPSF1Q10570 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
CPSF1Q10570 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
CPSF1Q10570 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
CPSF1Q10570 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
CPSF1Q10570 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CPSF1Q10570 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
CPSF1Q10570 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
CPSF1Q10570 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
CPSF1Q10570 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
CPSF1Q10570 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
CPSF1Q10570 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
CPSF1Q10570 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
CPSF1Q10570 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CPSF1Q10570 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CPSF1Q10570 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CPSF1Q10570 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CPSF1Q10570 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
CPSF1Q10570 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CPSF1Q10570 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
CPSF1Q10570 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CPSF1Q10570 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CPSF1Q10570 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CPSF1Q10570 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CPSF1Q10570 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CPSF1Q10570 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CPSF1Q10570 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CPSF1Q10570 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CPSF1Q10570 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
CPSF1Q10570 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CPSF1Q10570 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
CPSF1Q10570 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
CPSF1Q10570 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
CPSF1Q10570 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
CPSF1Q10570 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CPSF1Q10570 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CPSF1Q10570 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CPSF1Q10570 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CPSF1Q10570 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CPSF1Q10570 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
CPSF1Q10570 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CPSF1Q10570 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CPSF1Q10570 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CPSF1Q10570 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CPSF1Q10570 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CPSF1Q10570 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CPSF1Q10570 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CPSF1Q10570 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CPSF1Q10570 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CPSF1Q10570 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CPSF1Q10570 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
CPSF1Q10570 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CPSF1Q10570 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CPSF1Q10570 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CPSF1Q10570 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CPSF1Q10570 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CPSF1Q10570 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CPSF1Q10570 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CPSF1Q10570 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CPSF1Q10570 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CPSF1Q10570 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CPSF1Q10570 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CPSF1Q10570 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CPSF1Q10570 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CPSF1Q10570 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
CPSF1Q10570 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CPSF1Q10570 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CPSF1Q10570 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CPSF1Q10570 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
CPSF1Q10570 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CPSF1Q10570 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
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