Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEFA6Q01524 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEFA6Q01524 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEFA6Q01524 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEFA6Q01524 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEFA6Q01524 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEFA6Q01524 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEFA6Q01524 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEFA6Q01524 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DEFA6Q01524 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DEFA6Q01524 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEFA6Q01524 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DEFA6Q01524 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEFA6Q01524 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DEFA6Q01524 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEFA6Q01524 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEFA6Q01524 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DEFA6Q01524 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DEFA6Q01524 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DEFA6Q01524 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEFA6Q01524 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEFA6Q01524 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DEFA6Q01524 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DEFA6Q01524 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DEFA6Q01524 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA6Q01524 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA6Q01524 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DEFA6Q01524 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DEFA6Q01524 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEFA6Q01524 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DEFA6Q01524 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DEFA6Q01524 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DEFA6Q01524 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEFA6Q01524 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEFA6Q01524 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DEFA6Q01524 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DEFA6Q01524 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEFA6Q01524 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DEFA6Q01524 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEFA6Q01524 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEFA6Q01524 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEFA6Q01524 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DEFA6Q01524 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEFA6Q01524 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEFA6Q01524 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEFA6Q01524 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEFA6Q01524 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEFA6Q01524 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DEFA6Q01524 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEFA6Q01524 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DEFA6Q01524 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DEFA6Q01524 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DEFA6Q01524 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEFA6Q01524 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DEFA6Q01524 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DEFA6Q01524 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DEFA6Q01524 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DEFA6Q01524 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DEFA6Q01524 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DEFA6Q01524 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEFA6Q01524 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEFA6Q01524 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEFA6Q01524 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DEFA6Q01524 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEFA6Q01524 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DEFA6Q01524 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DEFA6Q01524 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DEFA6Q01524 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DEFA6Q01524 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEFA6Q01524 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DEFA6Q01524 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DEFA6Q01524 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DEFA6Q01524 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DEFA6Q01524 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DEFA6Q01524 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DEFA6Q01524 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DEFA6Q01524 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DEFA6Q01524 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEFA6Q01524 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DEFA6Q01524 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEFA6Q01524 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DEFA6Q01524 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DEFA6Q01524 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DEFA6Q01524 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEFA6Q01524 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEFA6Q01524 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEFA6Q01524 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEFA6Q01524 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DEFA6Q01524 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DEFA6Q01524 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEFA6Q01524 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DEFA6Q01524 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEFA6Q01524 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEFA6Q01524 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEFA6Q01524 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DEFA6Q01524 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DEFA6Q01524 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEFA6Q01524 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DEFA6Q01524 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DEFA6Q01524 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.5 ms