Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CD83Q01151 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CD83Q01151 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CD83Q01151 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD83Q01151 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD83Q01151 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD83Q01151 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD83Q01151 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD83Q01151 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD83Q01151 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD83Q01151 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD83Q01151 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD83Q01151 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD83Q01151 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD83Q01151 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD83Q01151 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CD83Q01151 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CD83Q01151 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD83Q01151 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD83Q01151 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD83Q01151 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD83Q01151 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD83Q01151 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD83Q01151 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CD83Q01151 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD83Q01151 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD83Q01151 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD83Q01151 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD83Q01151 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD83Q01151 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD83Q01151 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD83Q01151 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD83Q01151 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD83Q01151 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD83Q01151 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD83Q01151 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD83Q01151 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD83Q01151 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD83Q01151 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD83Q01151 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD83Q01151 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD83Q01151 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD83Q01151 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD83Q01151 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD83Q01151 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD83Q01151 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD83Q01151 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD83Q01151 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD83Q01151 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD83Q01151 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD83Q01151 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD83Q01151 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CD83Q01151 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD83Q01151 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD83Q01151 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD83Q01151 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD83Q01151 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CD83Q01151 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD83Q01151 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD83Q01151 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD83Q01151 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD83Q01151 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD83Q01151 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD83Q01151 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD83Q01151 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD83Q01151 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD83Q01151 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD83Q01151 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD83Q01151 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD83Q01151 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD83Q01151 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CD83Q01151 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD83Q01151 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD83Q01151 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD83Q01151 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CD83Q01151 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD83Q01151 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD83Q01151 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD83Q01151 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD83Q01151 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD83Q01151 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD83Q01151 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD83Q01151 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD83Q01151 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD83Q01151 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD83Q01151 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD83Q01151 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD83Q01151 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD83Q01151 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD83Q01151 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD83Q01151 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CD83Q01151 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD83Q01151 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD83Q01151 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD83Q01151 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD83Q01151 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CD83Q01151 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD83Q01151 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD83Q01151 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD83Q01151 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms