Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TUBA4AP68366 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TUBA4AP68366 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TUBA4AP68366 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBA4AP68366 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBA4AP68366 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUBA4AP68366 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBA4AP68366 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBA4AP68366 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBA4AP68366 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBA4AP68366 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBA4AP68366 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBA4AP68366 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBA4AP68366 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBA4AP68366 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBA4AP68366 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBA4AP68366 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBA4AP68366 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBA4AP68366 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBA4AP68366 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBA4AP68366 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBA4AP68366 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBA4AP68366 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBA4AP68366 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBA4AP68366 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBA4AP68366 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBA4AP68366 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBA4AP68366 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBA4AP68366 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBA4AP68366 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBA4AP68366 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBA4AP68366 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBA4AP68366 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBA4AP68366 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBA4AP68366 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBA4AP68366 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBA4AP68366 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBA4AP68366 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBA4AP68366 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBA4AP68366 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TUBA4AP68366 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBA4AP68366 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBA4AP68366 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBA4AP68366 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBA4AP68366 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBA4AP68366 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBA4AP68366 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBA4AP68366 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBA4AP68366 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBA4AP68366 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBA4AP68366 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBA4AP68366 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBA4AP68366 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBA4AP68366 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TUBA4AP68366 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBA4AP68366 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBA4AP68366 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBA4AP68366 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBA4AP68366 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBA4AP68366 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBA4AP68366 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBA4AP68366 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBA4AP68366 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBA4AP68366 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBA4AP68366 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBA4AP68366 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBA4AP68366 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBA4AP68366 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBA4AP68366 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBA4AP68366 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBA4AP68366 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBA4AP68366 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBA4AP68366 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBA4AP68366 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TUBA4AP68366 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TUBA4AP68366 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TUBA4AP68366 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBA4AP68366 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBA4AP68366 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBA4AP68366 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBA4AP68366 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBA4AP68366 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBA4AP68366 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBA4AP68366 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBA4AP68366 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBA4AP68366 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBA4AP68366 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBA4AP68366 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBA4AP68366 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBA4AP68366 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBA4AP68366 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBA4AP68366 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBA4AP68366 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBA4AP68366 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBA4AP68366 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBA4AP68366 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBA4AP68366 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBA4AP68366 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBA4AP68366 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBA4AP68366 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms