Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PROK1P58294 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PROK1P58294 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROK1P58294 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROK1P58294 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROK1P58294 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROK1P58294 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PROK1P58294 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROK1P58294 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PROK1P58294 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PROK1P58294 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PROK1P58294 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROK1P58294 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROK1P58294 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROK1P58294 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROK1P58294 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROK1P58294 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROK1P58294 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROK1P58294 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROK1P58294 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROK1P58294 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PROK1P58294 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROK1P58294 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROK1P58294 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROK1P58294 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROK1P58294 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROK1P58294 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROK1P58294 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROK1P58294 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROK1P58294 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROK1P58294 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROK1P58294 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROK1P58294 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROK1P58294 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROK1P58294 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROK1P58294 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROK1P58294 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROK1P58294 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROK1P58294 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROK1P58294 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROK1P58294 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PROK1P58294 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PROK1P58294 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROK1P58294 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROK1P58294 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROK1P58294 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PROK1P58294 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROK1P58294 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PROK1P58294 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROK1P58294 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROK1P58294 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROK1P58294 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROK1P58294 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROK1P58294 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROK1P58294 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROK1P58294 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROK1P58294 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PROK1P58294 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PROK1P58294 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROK1P58294 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROK1P58294 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROK1P58294 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROK1P58294 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROK1P58294 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROK1P58294 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROK1P58294 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PROK1P58294 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROK1P58294 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROK1P58294 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROK1P58294 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROK1P58294 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROK1P58294 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROK1P58294 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROK1P58294 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROK1P58294 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PROK1P58294 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PROK1P58294 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PROK1P58294 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROK1P58294 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROK1P58294 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROK1P58294 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PROK1P58294 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROK1P58294 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROK1P58294 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROK1P58294 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROK1P58294 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROK1P58294 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROK1P58294 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROK1P58294 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROK1P58294 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PROK1P58294 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROK1P58294 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROK1P58294 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PROK1P58294 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROK1P58294 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROK1P58294 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROK1P58294 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PROK1P58294 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROK1P58294 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PROK1P58294 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms