Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP107P57740 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NUP107P57740 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NUP107P57740 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NUP107P57740 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NUP107P57740 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP107P57740 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP107P57740 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP107P57740 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP107P57740 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NUP107P57740 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NUP107P57740 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP107P57740 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NUP107P57740 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NUP107P57740 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NUP107P57740 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NUP107P57740 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NUP107P57740 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NUP107P57740 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP107P57740 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NUP107P57740 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NUP107P57740 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP107P57740 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP107P57740 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP107P57740 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NUP107P57740 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NUP107P57740 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NUP107P57740 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP107P57740 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUP107P57740 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP107P57740 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUP107P57740 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP107P57740 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUP107P57740 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUP107P57740 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUP107P57740 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUP107P57740 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUP107P57740 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP107P57740 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP107P57740 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP107P57740 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP107P57740 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NUP107P57740 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP107P57740 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP107P57740 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP107P57740 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP107P57740 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP107P57740 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NUP107P57740 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP107P57740 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP107P57740 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP107P57740 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP107P57740 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP107P57740 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NUP107P57740 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NUP107P57740 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP107P57740 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NUP107P57740 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP107P57740 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NUP107P57740 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP107P57740 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NUP107P57740 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP107P57740 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP107P57740 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NUP107P57740 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP107P57740 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NUP107P57740 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NUP107P57740 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NUP107P57740 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NUP107P57740 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP107P57740 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP107P57740 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NUP107P57740 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NUP107P57740 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP107P57740 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NUP107P57740 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP107P57740 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP107P57740 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP107P57740 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NUP107P57740 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP107P57740 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP107P57740 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NUP107P57740 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP107P57740 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NUP107P57740 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NUP107P57740 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP107P57740 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP107P57740 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP107P57740 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP107P57740 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP107P57740 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP107P57740 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP107P57740 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP107P57740 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP107P57740 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP107P57740 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP107P57740 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP107P57740 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP107P57740 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP107P57740 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms