Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCKBRP32239 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCKBRP32239 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCKBRP32239 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCKBRP32239 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCKBRP32239 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCKBRP32239 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCKBRP32239 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCKBRP32239 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCKBRP32239 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCKBRP32239 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCKBRP32239 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCKBRP32239 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCKBRP32239 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCKBRP32239 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCKBRP32239 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCKBRP32239 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCKBRP32239 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCKBRP32239 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCKBRP32239 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCKBRP32239 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCKBRP32239 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCKBRP32239 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCKBRP32239 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCKBRP32239 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCKBRP32239 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCKBRP32239 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCKBRP32239 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCKBRP32239 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCKBRP32239 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCKBRP32239 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCKBRP32239 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCKBRP32239 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCKBRP32239 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCKBRP32239 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCKBRP32239 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCKBRP32239 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCKBRP32239 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCKBRP32239 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCKBRP32239 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCKBRP32239 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCKBRP32239 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCKBRP32239 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCKBRP32239 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCKBRP32239 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCKBRP32239 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCKBRP32239 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCKBRP32239 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCKBRP32239 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCKBRP32239 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCKBRP32239 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCKBRP32239 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCKBRP32239 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCKBRP32239 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCKBRP32239 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCKBRP32239 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCKBRP32239 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCKBRP32239 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCKBRP32239 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCKBRP32239 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCKBRP32239 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCKBRP32239 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCKBRP32239 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCKBRP32239 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCKBRP32239 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCKBRP32239 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCKBRP32239 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCKBRP32239 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCKBRP32239 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCKBRP32239 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCKBRP32239 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCKBRP32239 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCKBRP32239 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCKBRP32239 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCKBRP32239 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCKBRP32239 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCKBRP32239 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCKBRP32239 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCKBRP32239 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCKBRP32239 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCKBRP32239 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCKBRP32239 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCKBRP32239 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCKBRP32239 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCKBRP32239 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCKBRP32239 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCKBRP32239 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCKBRP32239 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCKBRP32239 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCKBRP32239 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCKBRP32239 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCKBRP32239 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCKBRP32239 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCKBRP32239 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCKBRP32239 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCKBRP32239 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCKBRP32239 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCKBRP32239 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCKBRP32239 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCKBRP32239 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms