Protein–RNA interactions for Protein: P26367

PAX6, Paired box protein Pax-6, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX6P26367 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAX6P26367 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAX6P26367 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAX6P26367 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAX6P26367 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAX6P26367 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAX6P26367 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PAX6P26367 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAX6P26367 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PAX6P26367 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAX6P26367 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PAX6P26367 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PAX6P26367 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAX6P26367 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PAX6P26367 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PAX6P26367 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAX6P26367 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PAX6P26367 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAX6P26367 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PAX6P26367 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PAX6P26367 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX6P26367 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PAX6P26367 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX6P26367 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAX6P26367 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAX6P26367 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAX6P26367 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAX6P26367 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAX6P26367 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAX6P26367 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAX6P26367 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAX6P26367 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAX6P26367 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAX6P26367 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PAX6P26367 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAX6P26367 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAX6P26367 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAX6P26367 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PAX6P26367 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PAX6P26367 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX6P26367 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PAX6P26367 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX6P26367 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PAX6P26367 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PAX6P26367 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PAX6P26367 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAX6P26367 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX6P26367 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX6P26367 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAX6P26367 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX6P26367 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAX6P26367 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAX6P26367 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAX6P26367 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAX6P26367 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX6P26367 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAX6P26367 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAX6P26367 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAX6P26367 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAX6P26367 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAX6P26367 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAX6P26367 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX6P26367 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAX6P26367 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PAX6P26367 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX6P26367 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAX6P26367 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAX6P26367 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX6P26367 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAX6P26367 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAX6P26367 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAX6P26367 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAX6P26367 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX6P26367 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX6P26367 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX6P26367 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX6P26367 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX6P26367 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX6P26367 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX6P26367 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX6P26367 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX6P26367 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX6P26367 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAX6P26367 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAX6P26367 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAX6P26367 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAX6P26367 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAX6P26367 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAX6P26367 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAX6P26367 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAX6P26367 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAX6P26367 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAX6P26367 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAX6P26367 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAX6P26367 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX6P26367 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX6P26367 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX6P26367 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAX6P26367 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAX6P26367 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms