Protein–RNA interactions for Protein: P26367

PAX6, Paired box protein Pax-6, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX6P26367 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAX6P26367 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PAX6P26367 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAX6P26367 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PAX6P26367 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PAX6P26367 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PAX6P26367 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PAX6P26367 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAX6P26367 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PAX6P26367 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAX6P26367 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAX6P26367 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAX6P26367 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAX6P26367 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PAX6P26367 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAX6P26367 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAX6P26367 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAX6P26367 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAX6P26367 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAX6P26367 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAX6P26367 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAX6P26367 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAX6P26367 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PAX6P26367 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAX6P26367 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAX6P26367 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAX6P26367 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAX6P26367 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PAX6P26367 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAX6P26367 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAX6P26367 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAX6P26367 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAX6P26367 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PAX6P26367 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAX6P26367 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAX6P26367 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAX6P26367 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAX6P26367 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAX6P26367 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PAX6P26367 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PAX6P26367 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAX6P26367 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PAX6P26367 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PAX6P26367 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAX6P26367 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PAX6P26367 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAX6P26367 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAX6P26367 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PAX6P26367 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAX6P26367 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAX6P26367 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAX6P26367 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAX6P26367 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PAX6P26367 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAX6P26367 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PAX6P26367 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAX6P26367 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAX6P26367 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PAX6P26367 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAX6P26367 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAX6P26367 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAX6P26367 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAX6P26367 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAX6P26367 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAX6P26367 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAX6P26367 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAX6P26367 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAX6P26367 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAX6P26367 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PAX6P26367 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAX6P26367 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAX6P26367 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAX6P26367 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAX6P26367 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAX6P26367 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAX6P26367 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAX6P26367 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAX6P26367 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAX6P26367 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAX6P26367 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAX6P26367 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAX6P26367 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAX6P26367 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAX6P26367 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAX6P26367 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAX6P26367 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAX6P26367 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAX6P26367 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAX6P26367 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAX6P26367 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX6P26367 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAX6P26367 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX6P26367 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX6P26367 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX6P26367 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAX6P26367 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PAX6P26367 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX6P26367 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAX6P26367 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAX6P26367 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms