Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB4P17483 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB4P17483 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB4P17483 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXB4P17483 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXB4P17483 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXB4P17483 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB4P17483 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB4P17483 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXB4P17483 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB4P17483 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB4P17483 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXB4P17483 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXB4P17483 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXB4P17483 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB4P17483 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB4P17483 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB4P17483 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB4P17483 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB4P17483 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB4P17483 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB4P17483 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB4P17483 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXB4P17483 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB4P17483 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB4P17483 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB4P17483 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB4P17483 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB4P17483 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB4P17483 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB4P17483 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB4P17483 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB4P17483 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB4P17483 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB4P17483 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB4P17483 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB4P17483 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB4P17483 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB4P17483 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB4P17483 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB4P17483 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB4P17483 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB4P17483 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB4P17483 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB4P17483 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB4P17483 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXB4P17483 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB4P17483 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB4P17483 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXB4P17483 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB4P17483 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB4P17483 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB4P17483 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB4P17483 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB4P17483 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB4P17483 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB4P17483 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB4P17483 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB4P17483 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB4P17483 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB4P17483 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB4P17483 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB4P17483 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB4P17483 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB4P17483 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB4P17483 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB4P17483 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB4P17483 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB4P17483 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB4P17483 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB4P17483 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB4P17483 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB4P17483 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXB4P17483 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXB4P17483 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXB4P17483 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB4P17483 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB4P17483 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB4P17483 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB4P17483 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB4P17483 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB4P17483 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB4P17483 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB4P17483 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB4P17483 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXB4P17483 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXB4P17483 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXB4P17483 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXB4P17483 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXB4P17483 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB4P17483 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB4P17483 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXB4P17483 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB4P17483 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXB4P17483 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB4P17483 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXB4P17483 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXB4P17483 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXB4P17483 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXB4P17483 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms