Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCL4P13236 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCL4P13236 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCL4P13236 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCL4P13236 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCL4P13236 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCL4P13236 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCL4P13236 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCL4P13236 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCL4P13236 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCL4P13236 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCL4P13236 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCL4P13236 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCL4P13236 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCL4P13236 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCL4P13236 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCL4P13236 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCL4P13236 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCL4P13236 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCL4P13236 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCL4P13236 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCL4P13236 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCL4P13236 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCL4P13236 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCL4P13236 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCL4P13236 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCL4P13236 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCL4P13236 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCL4P13236 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCL4P13236 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCL4P13236 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCL4P13236 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCL4P13236 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCL4P13236 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCL4P13236 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCL4P13236 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCL4P13236 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCL4P13236 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCL4P13236 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCL4P13236 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCL4P13236 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCL4P13236 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCL4P13236 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCL4P13236 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCL4P13236 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCL4P13236 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCL4P13236 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCL4P13236 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCL4P13236 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCL4P13236 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCL4P13236 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCL4P13236 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCL4P13236 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCL4P13236 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCL4P13236 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCL4P13236 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCL4P13236 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCL4P13236 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCL4P13236 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCL4P13236 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCL4P13236 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCL4P13236 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCL4P13236 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCL4P13236 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCL4P13236 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCL4P13236 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCL4P13236 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCL4P13236 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCL4P13236 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCL4P13236 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCL4P13236 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCL4P13236 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCL4P13236 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCL4P13236 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCL4P13236 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCL4P13236 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCL4P13236 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCL4P13236 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCL4P13236 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL4P13236 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCL4P13236 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCL4P13236 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCL4P13236 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCL4P13236 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL4P13236 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL4P13236 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL4P13236 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL4P13236 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL4P13236 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCL4P13236 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCL4P13236 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCL4P13236 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCL4P13236 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCL4P13236 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCL4P13236 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCL4P13236 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCL4P13236 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCL4P13236 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCL4P13236 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCL4P13236 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms