Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
RGPD1P0DJD0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
RGPD1P0DJD0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
RGPD1P0DJD0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
RGPD1P0DJD0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
RGPD1P0DJD0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
RGPD1P0DJD0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC39.6■■■■□ 3.93
RGPD1P0DJD0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
RGPD1P0DJD0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
RGPD1P0DJD0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
RGPD1P0DJD0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
RGPD1P0DJD0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
RGPD1P0DJD0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
RGPD1P0DJD0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RGPD1P0DJD0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RGPD1P0DJD0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
RGPD1P0DJD0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
RGPD1P0DJD0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
RGPD1P0DJD0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
RGPD1P0DJD0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
RGPD1P0DJD0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
RGPD1P0DJD0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
RGPD1P0DJD0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RGPD1P0DJD0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
RGPD1P0DJD0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
RGPD1P0DJD0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
RGPD1P0DJD0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
RGPD1P0DJD0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
RGPD1P0DJD0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
RGPD1P0DJD0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
RGPD1P0DJD0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
RGPD1P0DJD0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39■■■■□ 3.83
RGPD1P0DJD0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
RGPD1P0DJD0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
RGPD1P0DJD0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC38.94■■■■□ 3.82
RGPD1P0DJD0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
RGPD1P0DJD0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
RGPD1P0DJD0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
RGPD1P0DJD0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
RGPD1P0DJD0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
RGPD1P0DJD0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
RGPD1P0DJD0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
RGPD1P0DJD0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
RGPD1P0DJD0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
RGPD1P0DJD0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
RGPD1P0DJD0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
RGPD1P0DJD0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
RGPD1P0DJD0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RGPD1P0DJD0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RGPD1P0DJD0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
RGPD1P0DJD0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
RGPD1P0DJD0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
RGPD1P0DJD0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RGPD1P0DJD0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RGPD1P0DJD0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
RGPD1P0DJD0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
RGPD1P0DJD0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RGPD1P0DJD0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
RGPD1P0DJD0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RGPD1P0DJD0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RGPD1P0DJD0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RGPD1P0DJD0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
RGPD1P0DJD0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
RGPD1P0DJD0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
RGPD1P0DJD0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
RGPD1P0DJD0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
RGPD1P0DJD0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
RGPD1P0DJD0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RGPD1P0DJD0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
RGPD1P0DJD0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
RGPD1P0DJD0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RGPD1P0DJD0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RGPD1P0DJD0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
RGPD1P0DJD0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
RGPD1P0DJD0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
RGPD1P0DJD0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
RGPD1P0DJD0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
RGPD1P0DJD0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
RGPD1P0DJD0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
RGPD1P0DJD0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
RGPD1P0DJD0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
RGPD1P0DJD0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
RGPD1P0DJD0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
RGPD1P0DJD0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
RGPD1P0DJD0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
RGPD1P0DJD0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
RGPD1P0DJD0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
RGPD1P0DJD0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
RGPD1P0DJD0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
RGPD1P0DJD0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
RGPD1P0DJD0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
RGPD1P0DJD0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
RGPD1P0DJD0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
RGPD1P0DJD0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
RGPD1P0DJD0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
RGPD1P0DJD0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RGPD1P0DJD0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
RGPD1P0DJD0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RGPD1P0DJD0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
RGPD1P0DJD0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms