Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
MMP3P08254 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MMP3P08254 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MMP3P08254 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MMP3P08254 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MMP3P08254 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MMP3P08254 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MMP3P08254 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MMP3P08254 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MMP3P08254 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MMP3P08254 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
MMP3P08254 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MMP3P08254 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MMP3P08254 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MMP3P08254 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MMP3P08254 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MMP3P08254 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MMP3P08254 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
MMP3P08254 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MMP3P08254 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
MMP3P08254 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MMP3P08254 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MMP3P08254 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MMP3P08254 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MMP3P08254 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MMP3P08254 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MMP3P08254 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
MMP3P08254 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MMP3P08254 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MMP3P08254 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MMP3P08254 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
MMP3P08254 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MMP3P08254 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MMP3P08254 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MMP3P08254 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
MMP3P08254 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MMP3P08254 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
MMP3P08254 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MMP3P08254 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MMP3P08254 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MMP3P08254 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MMP3P08254 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MMP3P08254 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MMP3P08254 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MMP3P08254 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MMP3P08254 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MMP3P08254 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MMP3P08254 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MMP3P08254 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MMP3P08254 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
MMP3P08254 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
MMP3P08254 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
MMP3P08254 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32■■■□□ 2.71
MMP3P08254 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
MMP3P08254 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
MMP3P08254 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MMP3P08254 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
MMP3P08254 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
MMP3P08254 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MMP3P08254 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
MMP3P08254 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
MMP3P08254 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
MMP3P08254 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MMP3P08254 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
MMP3P08254 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
MMP3P08254 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MMP3P08254 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MMP3P08254 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
MMP3P08254 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
MMP3P08254 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
MMP3P08254 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
MMP3P08254 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MMP3P08254 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MMP3P08254 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MMP3P08254 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
MMP3P08254 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MMP3P08254 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MMP3P08254 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MMP3P08254 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MMP3P08254 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MMP3P08254 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
MMP3P08254 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MMP3P08254 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MMP3P08254 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MMP3P08254 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
MMP3P08254 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
MMP3P08254 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MMP3P08254 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MMP3P08254 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MMP3P08254 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MMP3P08254 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MMP3P08254 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
MMP3P08254 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
MMP3P08254 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
MMP3P08254 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MMP3P08254 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MMP3P08254 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MMP3P08254 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
MMP3P08254 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MMP3P08254 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms