Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RASSF9O75901 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RASSF9O75901 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RASSF9O75901 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RASSF9O75901 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RASSF9O75901 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RASSF9O75901 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RASSF9O75901 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RASSF9O75901 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RASSF9O75901 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RASSF9O75901 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RASSF9O75901 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RASSF9O75901 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RASSF9O75901 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RASSF9O75901 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RASSF9O75901 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RASSF9O75901 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RASSF9O75901 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RASSF9O75901 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RASSF9O75901 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RASSF9O75901 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RASSF9O75901 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RASSF9O75901 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RASSF9O75901 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RASSF9O75901 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RASSF9O75901 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RASSF9O75901 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RASSF9O75901 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RASSF9O75901 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RASSF9O75901 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RASSF9O75901 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RASSF9O75901 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RASSF9O75901 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RASSF9O75901 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RASSF9O75901 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RASSF9O75901 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RASSF9O75901 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RASSF9O75901 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RASSF9O75901 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RASSF9O75901 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RASSF9O75901 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RASSF9O75901 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RASSF9O75901 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RASSF9O75901 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RASSF9O75901 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RASSF9O75901 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RASSF9O75901 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RASSF9O75901 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RASSF9O75901 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RASSF9O75901 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RASSF9O75901 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RASSF9O75901 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RASSF9O75901 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RASSF9O75901 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RASSF9O75901 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RASSF9O75901 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RASSF9O75901 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RASSF9O75901 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RASSF9O75901 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RASSF9O75901 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RASSF9O75901 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RASSF9O75901 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RASSF9O75901 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RASSF9O75901 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RASSF9O75901 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RASSF9O75901 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASSF9O75901 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASSF9O75901 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASSF9O75901 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RASSF9O75901 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RASSF9O75901 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RASSF9O75901 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RASSF9O75901 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RASSF9O75901 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASSF9O75901 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RASSF9O75901 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RASSF9O75901 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RASSF9O75901 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RASSF9O75901 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RASSF9O75901 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RASSF9O75901 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RASSF9O75901 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RASSF9O75901 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RASSF9O75901 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASSF9O75901 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASSF9O75901 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RASSF9O75901 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASSF9O75901 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RASSF9O75901 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASSF9O75901 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RASSF9O75901 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RASSF9O75901 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RASSF9O75901 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RASSF9O75901 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RASSF9O75901 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASSF9O75901 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASSF9O75901 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASSF9O75901 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RASSF9O75901 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RASSF9O75901 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms