Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RASSF9O75901 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RASSF9O75901 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RASSF9O75901 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
RASSF9O75901 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RASSF9O75901 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RASSF9O75901 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RASSF9O75901 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RASSF9O75901 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RASSF9O75901 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RASSF9O75901 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RASSF9O75901 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RASSF9O75901 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RASSF9O75901 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RASSF9O75901 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
RASSF9O75901 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RASSF9O75901 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RASSF9O75901 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RASSF9O75901 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RASSF9O75901 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RASSF9O75901 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RASSF9O75901 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RASSF9O75901 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RASSF9O75901 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RASSF9O75901 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RASSF9O75901 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RASSF9O75901 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RASSF9O75901 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RASSF9O75901 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RASSF9O75901 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RASSF9O75901 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RASSF9O75901 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RASSF9O75901 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RASSF9O75901 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RASSF9O75901 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RASSF9O75901 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RASSF9O75901 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RASSF9O75901 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RASSF9O75901 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
RASSF9O75901 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RASSF9O75901 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RASSF9O75901 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RASSF9O75901 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RASSF9O75901 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RASSF9O75901 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RASSF9O75901 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RASSF9O75901 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RASSF9O75901 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RASSF9O75901 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RASSF9O75901 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RASSF9O75901 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RASSF9O75901 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RASSF9O75901 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RASSF9O75901 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RASSF9O75901 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RASSF9O75901 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RASSF9O75901 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RASSF9O75901 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RASSF9O75901 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RASSF9O75901 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RASSF9O75901 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RASSF9O75901 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RASSF9O75901 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RASSF9O75901 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RASSF9O75901 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RASSF9O75901 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RASSF9O75901 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RASSF9O75901 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RASSF9O75901 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RASSF9O75901 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RASSF9O75901 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RASSF9O75901 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RASSF9O75901 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RASSF9O75901 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RASSF9O75901 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RASSF9O75901 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RASSF9O75901 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RASSF9O75901 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RASSF9O75901 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RASSF9O75901 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RASSF9O75901 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RASSF9O75901 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RASSF9O75901 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RASSF9O75901 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RASSF9O75901 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RASSF9O75901 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RASSF9O75901 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RASSF9O75901 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RASSF9O75901 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RASSF9O75901 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RASSF9O75901 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RASSF9O75901 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RASSF9O75901 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RASSF9O75901 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RASSF9O75901 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RASSF9O75901 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RASSF9O75901 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RASSF9O75901 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RASSF9O75901 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RASSF9O75901 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms