Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHUKO15111 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHUKO15111 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHUKO15111 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHUKO15111 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CHUKO15111 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHUKO15111 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHUKO15111 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHUKO15111 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHUKO15111 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHUKO15111 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHUKO15111 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHUKO15111 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHUKO15111 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHUKO15111 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHUKO15111 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHUKO15111 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHUKO15111 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHUKO15111 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHUKO15111 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHUKO15111 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHUKO15111 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHUKO15111 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHUKO15111 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHUKO15111 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHUKO15111 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHUKO15111 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CHUKO15111 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHUKO15111 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHUKO15111 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHUKO15111 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHUKO15111 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHUKO15111 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHUKO15111 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHUKO15111 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHUKO15111 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHUKO15111 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHUKO15111 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHUKO15111 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHUKO15111 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHUKO15111 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHUKO15111 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHUKO15111 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHUKO15111 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHUKO15111 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHUKO15111 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHUKO15111 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHUKO15111 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CHUKO15111 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHUKO15111 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHUKO15111 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHUKO15111 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHUKO15111 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHUKO15111 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHUKO15111 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHUKO15111 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHUKO15111 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHUKO15111 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHUKO15111 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHUKO15111 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHUKO15111 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHUKO15111 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHUKO15111 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHUKO15111 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHUKO15111 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CHUKO15111 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CHUKO15111 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CHUKO15111 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHUKO15111 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CHUKO15111 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CHUKO15111 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CHUKO15111 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHUKO15111 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHUKO15111 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHUKO15111 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHUKO15111 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHUKO15111 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHUKO15111 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CHUKO15111 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHUKO15111 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHUKO15111 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHUKO15111 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHUKO15111 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHUKO15111 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHUKO15111 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHUKO15111 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHUKO15111 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHUKO15111 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHUKO15111 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHUKO15111 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHUKO15111 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHUKO15111 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHUKO15111 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHUKO15111 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHUKO15111 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHUKO15111 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHUKO15111 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHUKO15111 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHUKO15111 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHUKO15111 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms