Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TOR1AO14656 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TOR1AO14656 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TOR1AO14656 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TOR1AO14656 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOR1AO14656 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOR1AO14656 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOR1AO14656 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOR1AO14656 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOR1AO14656 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOR1AO14656 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOR1AO14656 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOR1AO14656 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOR1AO14656 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOR1AO14656 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOR1AO14656 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOR1AO14656 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOR1AO14656 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOR1AO14656 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOR1AO14656 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOR1AO14656 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOR1AO14656 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOR1AO14656 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TOR1AO14656 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOR1AO14656 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOR1AO14656 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOR1AO14656 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOR1AO14656 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOR1AO14656 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOR1AO14656 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOR1AO14656 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOR1AO14656 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TOR1AO14656 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TOR1AO14656 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOR1AO14656 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOR1AO14656 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOR1AO14656 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TOR1AO14656 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOR1AO14656 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOR1AO14656 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TOR1AO14656 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TOR1AO14656 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TOR1AO14656 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TOR1AO14656 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TOR1AO14656 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TOR1AO14656 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOR1AO14656 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TOR1AO14656 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TOR1AO14656 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOR1AO14656 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TOR1AO14656 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TOR1AO14656 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TOR1AO14656 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TOR1AO14656 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOR1AO14656 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TOR1AO14656 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TOR1AO14656 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR1AO14656 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOR1AO14656 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR1AO14656 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOR1AO14656 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOR1AO14656 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOR1AO14656 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOR1AO14656 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOR1AO14656 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOR1AO14656 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOR1AO14656 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOR1AO14656 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOR1AO14656 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOR1AO14656 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOR1AO14656 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOR1AO14656 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOR1AO14656 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOR1AO14656 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOR1AO14656 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOR1AO14656 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOR1AO14656 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOR1AO14656 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOR1AO14656 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOR1AO14656 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOR1AO14656 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOR1AO14656 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOR1AO14656 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOR1AO14656 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOR1AO14656 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TOR1AO14656 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TOR1AO14656 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TOR1AO14656 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOR1AO14656 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TOR1AO14656 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOR1AO14656 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TOR1AO14656 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOR1AO14656 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TOR1AO14656 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOR1AO14656 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOR1AO14656 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TOR1AO14656 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOR1AO14656 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TOR1AO14656 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TOR1AO14656 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms