Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
J3QKU1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
J3QKU1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
J3QKU1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
J3QKU1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
J3QKU1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
J3QKU1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
J3QKU1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
J3QKU1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
J3QKU1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
J3QKU1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
J3QKU1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
J3QKU1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
J3QKU1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
J3QKU1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
J3QKU1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
J3QKU1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
J3QKU1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
J3QKU1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
J3QKU1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
J3QKU1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
J3QKU1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
J3QKU1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
J3QKU1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
J3QKU1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
J3QKU1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
J3QKU1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
J3QKU1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
J3QKU1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
J3QKU1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
J3QKU1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
J3QKU1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
J3QKU1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
J3QKU1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
J3QKU1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
J3QKU1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
J3QKU1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
J3QKU1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
J3QKU1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
J3QKU1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
J3QKU1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
J3QKU1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
J3QKU1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
J3QKU1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
J3QKU1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
J3QKU1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
J3QKU1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
J3QKU1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
J3QKU1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
J3QKU1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
J3QKU1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
J3QKU1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
J3QKU1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
J3QKU1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
J3QKU1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
J3QKU1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
J3QKU1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
J3QKU1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
J3QKU1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
J3QKU1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
J3QKU1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
J3QKU1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
J3QKU1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
J3QKU1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
J3QKU1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
J3QKU1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
J3QKU1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
J3QKU1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
J3QKU1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
J3QKU1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
J3QKU1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
J3QKU1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
J3QKU1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
J3QKU1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
J3QKU1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
J3QKU1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
J3QKU1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
J3QKU1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
J3QKU1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
J3QKU1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
J3QKU1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
J3QKU1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
J3QKU1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
J3QKU1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
J3QKU1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
J3QKU1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
J3QKU1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
J3QKU1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
J3QKU1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
J3QKU1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
J3QKU1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
J3QKU1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
J3QKU1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
J3QKU1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
J3QKU1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
J3QKU1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
J3QKU1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
J3QKU1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
J3QKU1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
J3QKU1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms