Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC01549A6NIU2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC01549A6NIU2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC01549A6NIU2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01549A6NIU2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC01549A6NIU2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01549A6NIU2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01549A6NIU2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC01549A6NIU2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01549A6NIU2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01549A6NIU2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC01549A6NIU2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01549A6NIU2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINC01549A6NIU2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC01549A6NIU2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01549A6NIU2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC01549A6NIU2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC01549A6NIU2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC01549A6NIU2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC01549A6NIU2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC01549A6NIU2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC01549A6NIU2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC01549A6NIU2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC01549A6NIU2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC01549A6NIU2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC01549A6NIU2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01549A6NIU2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC01549A6NIU2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC01549A6NIU2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC01549A6NIU2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01549A6NIU2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01549A6NIU2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01549A6NIU2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC01549A6NIU2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC01549A6NIU2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01549A6NIU2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC01549A6NIU2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC01549A6NIU2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC01549A6NIU2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC01549A6NIU2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01549A6NIU2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01549A6NIU2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC01549A6NIU2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC01549A6NIU2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC01549A6NIU2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC01549A6NIU2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01549A6NIU2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01549A6NIU2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC01549A6NIU2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC01549A6NIU2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC01549A6NIU2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC01549A6NIU2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC01549A6NIU2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC01549A6NIU2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC01549A6NIU2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC01549A6NIU2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01549A6NIU2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC01549A6NIU2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC01549A6NIU2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC01549A6NIU2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC01549A6NIU2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC01549A6NIU2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC01549A6NIU2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC01549A6NIU2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC01549A6NIU2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC01549A6NIU2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC01549A6NIU2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC01549A6NIU2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC01549A6NIU2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC01549A6NIU2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC01549A6NIU2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC01549A6NIU2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01549A6NIU2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC01549A6NIU2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01549A6NIU2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC01549A6NIU2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC01549A6NIU2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC01549A6NIU2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01549A6NIU2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01549A6NIU2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC01549A6NIU2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC01549A6NIU2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01549A6NIU2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC01549A6NIU2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC01549A6NIU2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC01549A6NIU2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC01549A6NIU2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01549A6NIU2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01549A6NIU2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01549A6NIU2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01549A6NIU2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC01549A6NIU2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC01549A6NIU2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01549A6NIU2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01549A6NIU2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC01549A6NIU2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC01549A6NIU2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC01549A6NIU2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC01549A6NIU2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC01549A6NIU2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms