Protein–RNA interactions for Protein: A6NCS4

NKX2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-6A6NCS4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX2-6A6NCS4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX2-6A6NCS4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX2-6A6NCS4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX2-6A6NCS4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX2-6A6NCS4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX2-6A6NCS4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX2-6A6NCS4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NKX2-6A6NCS4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX2-6A6NCS4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX2-6A6NCS4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX2-6A6NCS4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX2-6A6NCS4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX2-6A6NCS4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX2-6A6NCS4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX2-6A6NCS4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NKX2-6A6NCS4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKX2-6A6NCS4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX2-6A6NCS4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX2-6A6NCS4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX2-6A6NCS4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX2-6A6NCS4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX2-6A6NCS4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX2-6A6NCS4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX2-6A6NCS4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NKX2-6A6NCS4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NKX2-6A6NCS4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-6A6NCS4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-6A6NCS4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NKX2-6A6NCS4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKX2-6A6NCS4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NKX2-6A6NCS4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX2-6A6NCS4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKX2-6A6NCS4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKX2-6A6NCS4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NKX2-6A6NCS4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NKX2-6A6NCS4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKX2-6A6NCS4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NKX2-6A6NCS4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX2-6A6NCS4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NKX2-6A6NCS4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKX2-6A6NCS4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKX2-6A6NCS4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKX2-6A6NCS4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NKX2-6A6NCS4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKX2-6A6NCS4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NKX2-6A6NCS4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NKX2-6A6NCS4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NKX2-6A6NCS4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NKX2-6A6NCS4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NKX2-6A6NCS4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NKX2-6A6NCS4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX2-6A6NCS4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NKX2-6A6NCS4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKX2-6A6NCS4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKX2-6A6NCS4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NKX2-6A6NCS4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NKX2-6A6NCS4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX2-6A6NCS4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NKX2-6A6NCS4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NKX2-6A6NCS4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX2-6A6NCS4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX2-6A6NCS4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX2-6A6NCS4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX2-6A6NCS4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NKX2-6A6NCS4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-6A6NCS4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NKX2-6A6NCS4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX2-6A6NCS4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX2-6A6NCS4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX2-6A6NCS4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX2-6A6NCS4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX2-6A6NCS4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX2-6A6NCS4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX2-6A6NCS4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX2-6A6NCS4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX2-6A6NCS4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX2-6A6NCS4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX2-6A6NCS4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX2-6A6NCS4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX2-6A6NCS4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NKX2-6A6NCS4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NKX2-6A6NCS4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NKX2-6A6NCS4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX2-6A6NCS4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX2-6A6NCS4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NKX2-6A6NCS4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NKX2-6A6NCS4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NKX2-6A6NCS4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKX2-6A6NCS4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKX2-6A6NCS4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKX2-6A6NCS4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKX2-6A6NCS4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX2-6A6NCS4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX2-6A6NCS4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX2-6A6NCS4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX2-6A6NCS4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX2-6A6NCS4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX2-6A6NCS4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKX2-6A6NCS4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms