Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CLRN2A0PK11 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
CLRN2A0PK11 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CLRN2A0PK11 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLRN2A0PK11 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CLRN2A0PK11 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CLRN2A0PK11 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLRN2A0PK11 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLRN2A0PK11 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CLRN2A0PK11 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CLRN2A0PK11 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLRN2A0PK11 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CLRN2A0PK11 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLRN2A0PK11 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLRN2A0PK11 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CLRN2A0PK11 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CLRN2A0PK11 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLRN2A0PK11 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLRN2A0PK11 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CLRN2A0PK11 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CLRN2A0PK11 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CLRN2A0PK11 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CLRN2A0PK11 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
CLRN2A0PK11 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLRN2A0PK11 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CLRN2A0PK11 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLRN2A0PK11 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CLRN2A0PK11 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CLRN2A0PK11 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLRN2A0PK11 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CLRN2A0PK11 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CLRN2A0PK11 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CLRN2A0PK11 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLRN2A0PK11 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLRN2A0PK11 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLRN2A0PK11 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLRN2A0PK11 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CLRN2A0PK11 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLRN2A0PK11 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CLRN2A0PK11 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CLRN2A0PK11 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
CLRN2A0PK11 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CLRN2A0PK11 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CLRN2A0PK11 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLRN2A0PK11 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLRN2A0PK11 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CLRN2A0PK11 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CLRN2A0PK11 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLRN2A0PK11 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLRN2A0PK11 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLRN2A0PK11 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLRN2A0PK11 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLRN2A0PK11 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLRN2A0PK11 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CLRN2A0PK11 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLRN2A0PK11 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLRN2A0PK11 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLRN2A0PK11 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLRN2A0PK11 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLRN2A0PK11 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CLRN2A0PK11 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CLRN2A0PK11 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLRN2A0PK11 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLRN2A0PK11 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLRN2A0PK11 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CLRN2A0PK11 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CLRN2A0PK11 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLRN2A0PK11 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CLRN2A0PK11 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLRN2A0PK11 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLRN2A0PK11 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLRN2A0PK11 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLRN2A0PK11 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLRN2A0PK11 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLRN2A0PK11 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLRN2A0PK11 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLRN2A0PK11 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLRN2A0PK11 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLRN2A0PK11 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLRN2A0PK11 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CLRN2A0PK11 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLRN2A0PK11 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLRN2A0PK11 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLRN2A0PK11 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CLRN2A0PK11 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLRN2A0PK11 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLRN2A0PK11 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLRN2A0PK11 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLRN2A0PK11 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLRN2A0PK11 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLRN2A0PK11 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CLRN2A0PK11 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CLRN2A0PK11 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CLRN2A0PK11 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLRN2A0PK11 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CLRN2A0PK11 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CLRN2A0PK11 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CLRN2A0PK11 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CLRN2A0PK11 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLRN2A0PK11 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms