Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.57■■■■■ 4.25
CLRN2A0PK11 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CLRN2A0PK11 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
CLRN2A0PK11 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
CLRN2A0PK11 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CLRN2A0PK11 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■□ 3.99
CLRN2A0PK11 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CLRN2A0PK11 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
CLRN2A0PK11 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CLRN2A0PK11 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CLRN2A0PK11 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CLRN2A0PK11 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CLRN2A0PK11 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CLRN2A0PK11 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CLRN2A0PK11 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CLRN2A0PK11 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CLRN2A0PK11 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CLRN2A0PK11 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CLRN2A0PK11 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
CLRN2A0PK11 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CLRN2A0PK11 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CLRN2A0PK11 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CLRN2A0PK11 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CLRN2A0PK11 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CLRN2A0PK11 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CLRN2A0PK11 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CLRN2A0PK11 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CLRN2A0PK11 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CLRN2A0PK11 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CLRN2A0PK11 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CLRN2A0PK11 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CLRN2A0PK11 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CLRN2A0PK11 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CLRN2A0PK11 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CLRN2A0PK11 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CLRN2A0PK11 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
CLRN2A0PK11 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CLRN2A0PK11 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CLRN2A0PK11 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CLRN2A0PK11 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CLRN2A0PK11 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CLRN2A0PK11 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CLRN2A0PK11 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CLRN2A0PK11 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLRN2A0PK11 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CLRN2A0PK11 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CLRN2A0PK11 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLRN2A0PK11 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CLRN2A0PK11 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLRN2A0PK11 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CLRN2A0PK11 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
CLRN2A0PK11 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLRN2A0PK11 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLRN2A0PK11 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLRN2A0PK11 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLRN2A0PK11 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLRN2A0PK11 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLRN2A0PK11 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLRN2A0PK11 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLRN2A0PK11 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLRN2A0PK11 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CLRN2A0PK11 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CLRN2A0PK11 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLRN2A0PK11 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLRN2A0PK11 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLRN2A0PK11 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLRN2A0PK11 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLRN2A0PK11 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLRN2A0PK11 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLRN2A0PK11 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
CLRN2A0PK11 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CLRN2A0PK11 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CLRN2A0PK11 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CLRN2A0PK11 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
CLRN2A0PK11 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CLRN2A0PK11 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CLRN2A0PK11 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CLRN2A0PK11 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CLRN2A0PK11 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
CLRN2A0PK11 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLRN2A0PK11 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CLRN2A0PK11 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
CLRN2A0PK11 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CLRN2A0PK11 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CLRN2A0PK11 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CLRN2A0PK11 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CLRN2A0PK11 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CLRN2A0PK11 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CLRN2A0PK11 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CLRN2A0PK11 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CLRN2A0PK11 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLRN2A0PK11 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CLRN2A0PK11 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CLRN2A0PK11 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CLRN2A0PK11 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
CLRN2A0PK11 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CLRN2A0PK11 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CLRN2A0PK11 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CLRN2A0PK11 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CLRN2A0PK11 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms